
問題的起因 看這篇文獻(xiàn)中關(guān)于WGCNA的方法步驟的時(shí)候,中間有個(gè)分析一直看不明白他是搞的什么東西來選擇hub基因涝滴。關(guān)于共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析绣版,他使用的是WGCNA分析,下邊分析的方法...
我這個(gè)人完全沒辦法在不了解算法的情況下用一個(gè)包,那樣我會(huì)瘋韩脏,可是網(wǎng)上居然完全找不到limma算法的講解資料缩麸,全是介紹怎么用的。 可能我太初級(jí)了骤素,這么簡(jiǎn)單的算法大概不值得一提…...
前言 limma的全稱是:Linear Models for Microarray Data 需要閱讀limma的官方說明:https://www.bioconductor....
寫在前面 感謝califano-lab[https://github.com/califano-lab]團(tuán)隊(duì)將代碼無私的分享出來=掰伸。=啤斗! 本流程需要一點(diǎn)點(diǎn)R語言與linux基...
寫在前面,這篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
前情回顧:?jiǎn)渭?xì)胞時(shí)代 || 細(xì)胞身份概念的演變[http://www.reibang.com/p/c56313177a31]單細(xì)胞時(shí)代 || 從眾病之王到希望之光[http...
轉(zhuǎn)自:https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCr...
生信分析過程中的文件格式:除了原始測(cè)序數(shù)據(jù)fastq、fasta之外饲帅,還有基因組文件fasta格式复凳,基因注釋文件gtf格式。在分析的過程中還會(huì)有眾多中間文件的生成灶泵,如bed育八、...
自定義方便些,一勞永逸
[R] 如何快速生成許多差異明顯的顏色钠惩?這個(gè)需求真的太常見了柒凉!注意問題強(qiáng)調(diào)的幾個(gè)關(guān)鍵詞:一是快速,二是大量篓跛,三是差異明顯膝捞。在生成大量元素比較圖時(shí)要明顯區(qū)分不同樣本,比如宏基因組中的物種分析: 方法一:自定義 自定義...
Ctrl+↑ 歷史命令檢索 Ctrl+Alt+Shift+M 批量替換變量名 Ctrl+Shift+R 段落注釋(方便折疊) 對(duì)雙引號(hào)中間按下Tab鍵,快速列出文件名拔第,方便讀...