matrix matrix > data.frame matrix > dist data.frame > dist dist > matrix原來的自我距離統(tǒng)一轉(zhuǎn)成0 di...
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R: data.frame dist matrix轉(zhuǎn)換
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R 常用微生物距離函數(shù)記錄
總結(jié)：第1、6枢泰、7距離算法較多逐工，但是1計算距離前無法對原始OTU進(jìn)行hellinger轉(zhuǎn)換铡溪，相反6和7均可以，但是7操作步驟稍顯復(fù)雜泪喊，使用6更快捷方便ps：怎么做hellin...
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[R] 如何快速生成許多差異明顯的顏色棕硫？這個需求真的太常見了！注意問題強(qiáng)調(diào)的幾個關(guān)鍵詞：一是快速袒啼，二是大量哈扮，三是差異明顯。在生成大量元素比較圖時要明顯區(qū)分不同樣本蚓再，比如宏基因組中的物種分析： 方法一：自定義 自定義...
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XCAVATOR檢測CNVXCAVATOR 軟件 檢測CNV的方法 當(dāng)前滑肉，檢測SV的主要方法有如下4種： 1.1 read count/depth of coverage (RC/DOC) 根據(jù)讀段在...
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MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaPhlAn-4[https://github.com/biob...
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生信數(shù)據(jù)分析常見格式（一）前言 首先靶庙，這篇文章介紹的文件格式格式：基因組fasta、測序數(shù)據(jù)fasta娃属、基因組不同軟件構(gòu)建的索引文件index六荒、fastq、sam膳犹、bam恬吕、bed签则、gtf须床、gff、vc...
