之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的輔助組裝，它的最大優(yōu)勢就是輸出結(jié)果可以對接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)進(jìn)行手動(dòng)矯正迄薄。然...
IP屬地：江蘇
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什么年代了，還在用傳統(tǒng)的3D-DNA？
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個(gè)性化ChIPseeker注釋peak結(jié)果在跳，基因 or 功能區(qū)類型隨心選岁忘，好用的腳本等你來取??ChIP-seq舵稠、ATAC-seq等獲取到基因組范圍內(nèi)的peak后蠢壹，需要對其進(jìn)行基因注釋以便進(jìn)行后續(xù)的分析嗓违。ChIPseeker做為peak注釋的R包，用來很不錯(cuò)图贸，但有時(shí)...
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GeneOverlap: 用于基因Overlap的檢驗(yàn)及可視化R包參考學(xué)習(xí)資料：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...
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第9篇：差異peaks分析——DiffBind學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評(píng)估兩個(gè)樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評(píng)估樣本間的關(guān)系 評(píng)估不同工具得到的差異peaks的一致性 評(píng)估差異peaks富集的工具 ATAC-...
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在wildfly 21中搭建cluster集群
簡介 wildfly是一個(gè)非常強(qiáng)大的工具蹂季，我們可以輕松的使用wildfly部署應(yīng)用程序，更為強(qiáng)大的是疏日，wildfly可以很方便的部署cluster應(yīng)用偿洁。 今天我們通過一個(gè)例子...
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CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（1）前幾天學(xué)習(xí)了文獻(xiàn)CUT&Tag[http://www.reibang.com/p/335aec753039]，了解了原理以后沟优，可以跟著官網(wǎng)來學(xué)習(xí)如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
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單細(xì)胞測序?qū)崙?zhàn)（第一部分）這次要練習(xí)的文章數(shù)據(jù)出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
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Hi-C分析練習(xí)（從fastq文件到contact矩陣）最近紐約復(fù)工涕滋，因?yàn)槊刻煲鰧?shí)驗(yàn)（還得全程戴口罩，非常悶得慌）挠阁，比不了之前每天都在家可以為所欲為的自學(xué)生信宾肺，所以更新也少了很多~ Hi-C的技術(shù)相關(guān)背景學(xué)習(xí)筆記我在之前有寫過（...
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基因組學(xué)中的深度學(xué)習(xí)全文6,743字，閱讀30分鐘侵俗。 這一篇文章的主題是深度學(xué)習(xí)在基因組學(xué)中的應(yīng)用情況的锨用。文章較長，讀完要花些時(shí)間隘谣，不過我的建議是通讀第一部分——關(guān)于如何進(jìn)行模型訓(xùn)練的內(nèi)容增拥，讀完...
