Pysam操作BAM文件 Pysam包是一個(gè)處理基因組數(shù)據(jù)的python模塊报慕，它打包了htslib-1.3枣察、samtools-1.3 和 bcftools-1.3的核心功能遮晚，...
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使用Pysam操作BAM文件
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python腳本截取fastq序列
前言 ??最近在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí)湃密，遇到了一個(gè)小的需求就是截取需要的fastq序列。先來說一下為什么有這個(gè)需求侧甫，一般來說單細(xì)胞的測(cè)序文件有三個(gè)如test_R1.fastq....
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群落多樣性之Alpha多樣性（一）
學(xué)習(xí)生物學(xué)若厚，一項(xiàng)很重要的事情就是理解概念拦英。有一種方法就是直接從名字上理解概念。小RNA盹沈，是不是就是很小的RNA龄章？宏基因組，是不是就是很“宏”的基因組乞封？……答案很統(tǒng)一：必須是啊...
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下載GEO數(shù)據(jù)做裙，R語(yǔ)言-做個(gè)基因的差異分析并且畫個(gè)熱圖展示1、下載GSE115850數(shù)據(jù) 2肃晚、讀取數(shù)據(jù)且處理數(shù)據(jù)锚贱，數(shù)據(jù)格式是這樣的： 接下來是要把行名改成基因名，又因?yàn)樾忻荒苁俏ㄒ坏牟荒苡兄貜?fù)关串，所以要把多個(gè)Ensembl對(duì)應(yīng)的同一...
