最近一段時(shí)間正在努力學(xué)習(xí)單細(xì)胞相關(guān)的理論知識(shí)宝与，發(fā)現(xiàn)單細(xì)胞測(cè)序和普通的真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組非常相似古今。兩者之間的最大的區(qū)別在于勾徽，一個(gè)測(cè)的是單個(gè)細(xì)胞的表達(dá)丰刊，一個(gè)測(cè)的是一堆細(xì)胞的表達(dá)之和...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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如何簡(jiǎn)單快捷的進(jìn)行單細(xì)胞分析 -
零代碼學(xué)生信第十一天-臨床特征的比較生信套路分析的文章中臨床表型的比較往往用來(lái)進(jìn)一步襯托基于特征基因構(gòu)建的分子亞型或者是風(fēng)險(xiǎn)模型坝锰，更具有臨床意義瘫絮，而這里的臨床意義更多的指的是宾添，預(yù)后價(jià)值和診斷價(jià)值锭弊。 這里給大家介...
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零代碼復(fù)現(xiàn)5-CAF細(xì)胞的套路文章原文鏈接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9537943/ 背景： 癌癥相關(guān)成纖維細(xì)胞 （CAF） 參與腫瘤生長(zhǎng)堪澎、...
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零代碼學(xué)生信第十天-差異基因的富集分析在上一節(jié)我們介紹了如何做差異法分析，通過(guò)差異分析可以了解在不同處理組存在哪些差異基因味滞，接下來(lái)樱蛤，我們需要對(duì)了解這些差異基因參與哪些生物學(xué)過(guò)程，有哪些生物功能剑鞍，這時(shí)候需要對(duì)差異基...
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零代碼學(xué)生信第九天-差異分析的可視化有哪些昨凡？前面學(xué)習(xí)怎么做差異分析，差異分析的R包是需要根據(jù)數(shù)據(jù)進(jìn)行選擇的蚁署，前面我們提到了芯片數(shù)據(jù)一般用limma包做差異便脊，高通量的二代測(cè)序如果是count數(shù)據(jù)（全是整數(shù)），可以選擇使用...
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零代碼學(xué)生信第八天-什么是差異分析光戈？怎么做差異分析哪痰？提到差異分析，大家都不陌生田度，什么是差異分析呢妒御？差異分析的目的是為了什么呢？怎么做差異分析呢镇饺？ 首先差異分析是什么乎莉？ 差異分析又可以被稱(chēng)為差距分析，主要就是為了查看兩組之間影響...
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零代碼復(fù)現(xiàn)3-肝細(xì)胞癌Anoikis相關(guān)亞群的鑒定及預(yù)后模型網(wǎng)址：http://www.sxdyc.com/zeroCodeTool 文章解讀的鏈接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxMjMxO...
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零代碼復(fù)現(xiàn)2-基于TGF-β個(gè)性化純生信套路經(jīng)過(guò)團(tuán)隊(duì)內(nèi)部加班加點(diǎn)奸笤，終于零代碼復(fù)現(xiàn)2與大家見(jiàn)面了惋啃，零代碼2的分析，更側(cè)重于某一個(gè)特定的功能集监右，進(jìn)行直接建模边灭，這個(gè)功能集可以從文獻(xiàn)中挖掘，KEGG 的通路健盒，疾病的相關(guān)功能绒瘦，單...
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零代碼復(fù)現(xiàn)1-BNIP3作為識(shí)別實(shí)體瘤預(yù)后和診斷的潛在生物標(biāo)志物本文復(fù)現(xiàn)的是一篇單基因泛癌的文章，原文鏈接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10466744/ 本文分析并不難扣癣，主...
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零代碼學(xué)生信第六天-怎么構(gòu)建風(fēng)險(xiǎn)模型（二）目前101算法組合用來(lái)構(gòu)建風(fēng)險(xiǎn)模型的文章越來(lái)越多了惰帽，那么這種分析怎么做的呢？ http://www.sxdyc.com/prognosticmodel 需要上傳四個(gè)文件 第一...
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零代碼學(xué)生信第五天-怎么構(gòu)建風(fēng)險(xiǎn)模型（一）NCBI一搜腫瘤的分析風(fēng)險(xiǎn)模型作為不可或缺的一部分父虑，幾乎是每一篇生信文章必不可少的部分该酗，那么我們到底怎么理解模型呢？ 準(zhǔn)確來(lái)說(shuō)，模型分兩種呜魄，一種是診斷模型悔叽，一種是預(yù)后模型，我...
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零代碼學(xué)生信第四天-單/多變量cox分析在腫瘤數(shù)據(jù)挖掘中爵嗅，單變量cox分析（單因素cox分析）和多變量cox分析（多因素cox分析）是非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)娇澎。他們的目的到底是什么了，之前看到他們?cè)诖鹨扇褐薪?jīng)常群主會(huì)回復(fù)...
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零代碼學(xué)生信第三天-什么是TIDE操骡？作為一個(gè)腫瘤科的小主治來(lái)說(shuō)九火，數(shù)據(jù)挖掘是一個(gè)不錯(cuò)的選擇赚窃，在看了很多文章后册招，我發(fā)現(xiàn)，基本上所有的腫瘤生信文章中勒极，不可避免的都有免疫分析是掰，在分析的過(guò)程中，會(huì)將樣本進(jìn)行分組辱匿，預(yù)后差的...
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零代碼學(xué)生信第二天-TIP是什么键痛？在免疫分析中，生信豆芽菜提供了一個(gè)TIP預(yù)測(cè)免疫 TIP預(yù)測(cè)免疫 - 生信豆芽菜 - 專(zhuān)門(mén)做分析的生信平臺(tái). (sxdyc.com) 他的操作其實(shí)很簡(jiǎn)單匾七，就是上傳一個(gè)表達(dá)譜數(shù)...
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零代碼學(xué)生信第一天-如何進(jìn)行免疫浸潤(rùn)分析作為一個(gè)底層打工人絮短，一邊搞臨床，一邊學(xué)生信昨忆，真的很崩潰丁频。最近發(fā)現(xiàn)零代碼學(xué)生信對(duì)于我們這樣的醫(yī)學(xué)生來(lái)說(shuō)實(shí)在是太友好了，為此邑贴，我把每天學(xué)習(xí)的心得寫(xiě)下來(lái)席里，也算一場(chǎng)美好的記錄吧！ 免...