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單細(xì)胞軟件學(xué)習(xí)--泛癌的TME細(xì)胞類型分類工具scATOMIC（single cell annotation of tumour microenvironments in pan-cancer ...一地啰、背景簡述 腫瘤微環(huán)境（Tumor micro-environment, TME）是指腫瘤細(xì)胞周圍異于正常內(nèi)環(huán)境的微環(huán)境君旦，具有缺氧劳跃、慢性炎癥及...
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conda 環(huán)境中默認(rèn)加載libPath情況一般在conda創(chuàng)建的環(huán)境中包蓝，安裝R軟件是安裝在 miniconda3/env/your_env/lib/R/library 目錄丈冬，但是后期在安...
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個人電腦上SRR數(shù)據(jù)下載第一種碍拆，在EBI 查找性芬，https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home[https://www.ebi.ac.uk...
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excel操作
批量取消隱藏的sheetAlt+F11，單擊插入瘦黑，模塊京革，運行 Sub ShowSheets()For Each Sheet In SheetsS...
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對SNP的VCF文件質(zhì)控篩選對SNP的VCF文件質(zhì)控篩選 1.vcfR簡介 vcfR is a package intended to help visualize, ma...
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定量分析htseq
HTSeq使用注意事項 簡述： HTSeq是轉(zhuǎn)錄組定量分析的軟件，其輸入文件必須有bam（sorted）和GTF文件幸斥。 一般情況下HTSeq得到...
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融合基因分析結(jié)果可視化融合基因匹摇，是指將兩個或多個基因的編碼區(qū)首尾相連,置于同一套調(diào)控序列(包括啟動子、增強子甲葬、核糖體結(jié)合序列廊勃、終止子等)控制之下,構(gòu)成的嵌合基因，融合...
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MISO 可視化學(xué)習(xí)miso是一個可變剪接可視化軟件，對mRNA水平或者外顯子水平的可變進(jìn)行可視化坡垫； 官網(wǎng) https://miso.readthedocs.io/...
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hisat2比對
基因組比對軟件常用bwa梭灿，轉(zhuǎn)錄組比對軟件常用bowtie2、hisat2等冰悠，其中有參考基因組的常用hisat2堡妒，沒有參考基因組的常用bowtie...