生信小書(shū)童

R包文檔參考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Case%20Study%201[h...

生物信息與育種

前言 這是代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一個(gè)R包吩愧，包括用于代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析淆攻、可視化和功能注釋等眾多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代謝流程择镇，安裝這個(gè)包出現(xiàn)了問(wèn)題髓考，于是我折騰了一上午仁卷。 ...

養(yǎng)豬場(chǎng)小老板

PSM: 平衡和矯正混雜因素 慎重選擇：可能會(huì)造成選擇性偏倚纵刘。因?yàn)槠ヅ浜螅氀M和非貧血組都刪掉部分人荸哟。那些刪掉的人可能就是有心血管事件的人假哎。比較靠譜的方法是：想在原始數(shù)據(jù)上...

生信學(xué)習(xí)者2

拆解地址 14 種差異分析方法步驟以及原理初解[https://xbiomeanalysis.github.io/XMAS_tutorial/principals-of-di...

六勝一平

傾向性得分匹配是一類(lèi)基于反事實(shí)理論的數(shù)據(jù)預(yù)處理方法，在醫(yī)學(xué)和政策研究中被廣泛應(yīng)用鞍历。R中有幾個(gè)很優(yōu)秀的包可用于開(kāi)展傾向性得分匹配舵抹，而其中功能較強(qiáng)、知名較廣劣砍、使用方便的當(dāng)屬M(fèi)at...

生信雜談

傾向性評(píng)分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...

科研那點(diǎn)事兒

????LEfSe（LDA Effect Size）分析是一種用于發(fā)現(xiàn)和解釋高維度數(shù)據(jù)生物標(biāo)識(shí)（基因惧蛹、通路和分類(lèi)單元等）的分析工具。在微生物分析過(guò)程中刑枝，這種分析方法主要采用線...