Tidymodels: tidy machine learning in R 在處理數(shù)據(jù)時顷链，有簡潔的工具包褒搔，tidyverse應(yīng)運而生，極大地簡化數(shù)據(jù)處理流程，讓數(shù)據(jù)處理變得...
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R機(jī)器學(xué)習(xí)的Tidymodel流水線編程 -
解決Docker以默認(rèn)root用戶運行生成的文件權(quán)限為root的問題
只需以宿主機(jī)的普通用戶運行即可吧享。 docker run --user $(id -u ${USER}):$(id -g ${USER}) -v /etc/passwd:/et...
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收錄比較基因組學(xué)旱函，進(jìn)化基因組學(xué)，群體基因組學(xué)描滔，分子進(jìn)化棒妨，及相關(guān)領(lǐng)域的各類文章。特別地含长。由于是簡書券腔，建樹的內(nèi)容當(dāng)然是必不可少了。 歡迎大家投稿
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分子進(jìn)化樹構(gòu)建及數(shù)據(jù)分析方法介紹【轉(zhuǎn)】
首先是方法的選擇拘泞》兹遥基于距離的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution陪腌，最小進(jìn)化法）和NJ（Neighbor-Joining辱魁，鄰接法）等。其他的幾種方法包括M...
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你可以重寫下诗鸭，當(dāng)時剛學(xué)正則染簇，寫的不好
KEGG pathway 注釋整理
KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過eggnog-mapper和interproscan兩個軟件(或數(shù)據(jù)庫)，可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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Linux和Windows間的遠(yuǎn)程桌面訪問在Windows上面强岸，我們都用過系統(tǒng)自帶的遠(yuǎn)程桌面連接或者TeamViewer這樣的工具锻弓，可以方便的讓我們用圖形化方式遠(yuǎn)程操作其他計算機(jī)。但是在Linux上蝌箍，我們一般都是使用...
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picrust2 預(yù)測功能PICRUSt2 PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobs...
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KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過eggnog-mapper和interproscan兩個軟件(或數(shù)據(jù)庫)击胜，可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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構(gòu)建非冗余rRNA數(shù)據(jù)庫
構(gòu)建非冗余rRNA數(shù)據(jù)庫 參考riboPicker官網(wǎng)文檔。 下載并安裝riboPicker 主要為了使用該軟件自帶的格式化腳本; 自帶的bwa程序版本是0.5.9-r16....
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生物信息分析常用文件格式和軟件
生物信息分析常用文件格式和軟件 文件格式 數(shù)據(jù)格式 fastq fasta 注釋 gtf gff bed bcf 比對格式 sam bam 工具類 數(shù)據(jù)質(zhì)控類 cutadap...
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用cmscan挖掘ncRNA信息（2019-11-4更新）
更新日志：2019年11月4日: 了解了一下預(yù)測的結(jié)果都是些啥2018年12月27日: 對部分內(nèi)容進(jìn)行了修正役纹，添加了新版本Rfam的下載鏈接偶摔。對Z參數(shù)的計算進(jìn)行了修改。201...
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bioconda channel設(shè)置如果要使用conda安裝生物信息學(xué)軟件促脉，就需要設(shè)置bioconda軟件源辰斋。下面是官方給出的設(shè)置方法： 在國內(nèi)建議使用中科大的源，設(shè)置命令如下瘸味， 設(shè)置好后宫仗，可以查看下conda...
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fasta/fastq序列長度分布統(tǒng)計首先得到每條序列的長度，在這里使用seqkit軟件旁仿。seqkit軟件是一個強(qiáng)大的序列處理工具藕夫，安裝方法參見官方網(wǎng)站.代碼如下： 結(jié)果如下所示： 將 Length.txt導(dǎo)入到...
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