歡迎來GitHub上fork，一起進(jìn)步： https://github.com/xuzhougeng 比對(duì)軟件很多，首先大家去收集一下亡电，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T刘陶，請(qǐng)統(tǒng)一用hisa...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：吉林
-
轉(zhuǎn)錄組入門（5）： 序列比對(duì) -
單端測(cè)序與雙末端測(cè)序問題
問題 Paired-End測(cè)序與Mate-Pair測(cè)序相對(duì)于單端測(cè)序有何優(yōu)勢(shì)鉴腻？ Paired-End中的Read1和Read2到底是啥關(guān)系司致？它們是如何參與拼接和比對(duì)的呢辙售？ M...
-
GSEA學(xué)習(xí)筆記春節(jié)后的第一次寫學(xué)習(xí)筆記量淌，還是要提醒大家沒事別聚集骗村、別聚集、別聚集呀枢！重要的事情說三遍胚股！ 前幾天看到公眾號(hào)里寫了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多網(wǎng)上的教程走過一遍GSEA分析...
-
IGV 導(dǎo)入本地基因組及注釋文件IGV軟件有自帶的基因組文件和注釋文件裙秋，使用自帶的還是方便一些琅拌。但是，其使用的注釋文件和基因組文件可能與我們數(shù)據(jù)分析時(shí)的不一致摘刑，這時(shí)候我們可視化bigwig文件或者bam文件...
-
karyoploteR：怎么用R來展示你的候選區(qū)域的基因結(jié)構(gòu)以及BigWig信息进宝，活學(xué)活用首先最重要的參考鏈接： [karyoploteR] https://bernatgel.github.io/karyoploter_tutorial/Examples/Enc...
-
karyoploteR畫enhancer附近的信號(hào)分布效果圖： 感覺就一個(gè)不好理解的參數(shù)：r0和r1r0：是起始的高度r1：是結(jié)束的高度r1-r0才是我們想要展示內(nèi)容的高度（想象這個(gè)畫布本身就有刻度線） 傳入的增強(qiáng)子文件格式：前...
-
-
2019意猶未盡的基因組可視化IGV（一）劉小澤寫于19.6.8之前最開始學(xué)習(xí)IGV的時(shí)候?qū)戇^兩篇推文，當(dāng)時(shí)簡(jiǎn)單做了了解枷恕，但有朋友說意猶未盡党晋，嗯我也這么覺得，總覺得還是學(xué)的不夠徐块。推薦閱讀：https://github...
