寫在前面 熱圖，或稱熱力圖，是外文 Heatmap 的直譯。在幾乎所有數(shù)值分析相關(guān)工作中都可以看到履因。生物信息學數(shù)據(jù)，自然躲不過。無論是形態(tài)數(shù)據(jù)闸婴，還是基因拷貝數(shù)數(shù)據(jù)，或是基因表...
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收藏貼之一 | 寫過熱圖工具的人，給你理清熱圖數(shù)據(jù)標準化 -
R包clusterProfiler: 轉(zhuǎn)換ID芍躏、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕邪乍，clusterProfiler幫你忙這篇詳細講了無參考基因組該怎么辦，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG開頭...
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折騰了許久才復(fù)現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面对竣，做出作者文章中那樣的圖溺欧，但是分組很復(fù)雜，需要去文章中找細節(jié)內(nèi)容柏肪，老大jimm...
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TCGA甲基化芯片數(shù)據(jù)的差異基因的生存分析與富集分析4.將差異甲基化位點拿來做批量生存分析 logrank test批量生存分析 這里和TCGA系列里的內(nèi)容是一樣的姐刁，詳見：兩種方法批量做生存分析 得到110個對生存影響顯著的差...
