今天給大家?guī)硪粋€老套路文章，文章分析方法其實都是大家已經(jīng)司空見慣的方法朝巫，但是它為啥能發(fā)到6分多鸿摇，讓我們一起去探個究竟~ 研究背景 目前已經(jīng)有研究表明，TP53突變可預(yù)測胃癌...
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胃癌免疫預(yù)后模型
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快捷查找KEGG里的通路和基因
需求 1.快捷查找ID對應(yīng)的description劈猿，知道通路對應(yīng)的編號是多少拙吉。2.找出某一個/幾個通路里的全部基因，用來做單獨的下游分析揪荣。 如果是要做KEGG的富集分析筷黔，cl...
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RAEdb:基于STARR-seq和MPRA數(shù)據(jù)的enhancers和Epromoters可視化
歡迎來到"bio生物信息"的世界 1 前言 盡管之前已經(jīng)有很多的數(shù)據(jù)庫收集了enhancers，比如EnhancerAtlas仗颈、 VISTA Enhancer Browser...
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每日一圖Marginal Histogram/Boxplot原文鏈接Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List (With Full R Code) If you want to s...
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GEO數(shù)據(jù)庫的id轉(zhuǎn)換嘗試過兩個方法下載探針矩陣數(shù)據(jù)：1.GEO網(wǎng)站直接下載txt佛舱。 probeMatrix<-read.table("GSE16011_series_matrix.txt",se...
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20201108-轉(zhuǎn)錄因子
什么是轉(zhuǎn)錄因子 轉(zhuǎn)錄因子（Transcriptionfactor，TF)是一個能與特異DNA序列結(jié)合的蛋白,可以單獨或與其他蛋白形成復(fù)合體挨决，提高或阻斷特性基因?qū)NA聚合酶的...
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limma 差異分析透徹講解基因表達(dá)差異分析是我們做轉(zhuǎn)錄組最關(guān)鍵根本的一步请祖，edgeR+limma是目前最為推薦的方式。本文結(jié)合示例數(shù)據(jù)凰棉，將對這個過程進(jìn)行梳理损拢，讓你明白limma包的why陌粹，what撒犀，h...
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文獻(xiàn)筆記Detection of Microbial Infections Through Innate Immune Sensing of Nucleic Acids.Tan, X., et al. （2018）. "Detection of Microbial Infections Through Innate ImmuneSensing...
