Circexplorer2 參考文檔： CIRCexplorer2手冊(cè) tophat的安裝與使用 這個(gè)主要記錄一下使用Circexplorer2的流程 目前已經(jīng)通過之前的步驟...
IP屬地：北京
-
200904 Circ之旅4.1-Circexplorer2
-
子宮內(nèi)膜癌circRNA數(shù)據(jù)分析（重分析）
項(xiàng)目目的 CIRI2和CIRCexplore,2聯(lián)合使用對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行circRNAs鑒定，并進(jìn)一步做下游的差異表達(dá)等分析梗逮。 項(xiàng)目流程 1·tophat，BWA用于map到參考基...
-
HISAT2 Bowtie2 提取唯一比對(duì) unique mapping reads
把read比對(duì)到基因組之后绣溜，需要提取唯一比對(duì)來進(jìn)行下一步分析慷彤。 bowtie2和HISAT2 都沒有只輸出唯一比對(duì)的命令，所以需要對(duì)比對(duì)結(jié)果sam文件進(jìn)行提取怖喻，可以通過sam...
-
R語(yǔ)言學(xué)習(xí)筆記之相關(guān)性矩陣分析及其可視化TaoYan 計(jì)算相關(guān)矩陣 R內(nèi)置函數(shù)cor()可以用來計(jì)算相關(guān)系數(shù)：cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman"))...
