pip本地安裝錯誤 當(dāng)本地安裝 出現(xiàn)下面報錯 可能有兩個原因 1凑耻，你的平臺不是Linux系統(tǒng)酿傍，需要重新下載對應(yīng)版本的whl文件察净。 2果复，可能下載的whl文件名不符合規(guī)范 首先查...
IP屬地：陜西
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# pip本地安裝錯誤
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**服務(wù)器免密登錄**
在日常學(xué)習(xí)工作中叙淌，我們經(jīng)常需要連接遠(yuǎn)程服務(wù)器互亮，每一次輸入密碼都很麻煩慢宗，或者是服務(wù)器本身設(shè)置就是必須免密登錄坪蚁，所以今天我就交大家如何免密登錄，以及如何在xshell和vs co...
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2、RNAseq(2)--測序原始數(shù)據(jù)處理（Clean data）1缅茉、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫嘴脾，于是首先第一步是對這些壓縮格式進(jìn)行解壓操作 解壓好的文件即正...
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# sigprofiler的安裝與使用sigprofiler的安裝與使用 SigProfiler提供了一套完整的生物信息學(xué)工具來進(jìn)行突變特征分析。該軟件涵蓋了分析流程，從生成突變矩陣開始译打，到完成特征提取耗拓，以及繪圖...
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寫代碼時遇到的小問題
有時我們在構(gòu)建函數(shù)后，用的時候會提示里面的一個對象找不到奏司，比如： 但是我們仔細(xì)檢查函數(shù)乔询，發(fā)現(xiàn)這個對象是存在的拆開來運行都不報錯，但一封裝起來就報錯韵洋。首先看你的對象是在函數(shù)外還...
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循環(huán)構(gòu)建多因素模型循環(huán)構(gòu)建多因素模型 目前在數(shù)據(jù)處理時哥谷，經(jīng)常會使用到回歸模型。有時你的自變量比較多麻献，不想一個一個打们妥，就需要構(gòu)建循環(huán)模型。循環(huán)模型根據(jù)單因素分析還是多因素分析勉吻，分為每次循環(huán)一個變...
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看下我下載hicpro2juicebox.sh的目錄
Hic-pro的結(jié)果文件轉(zhuǎn)化為.hic文件监婶，在juicebox中實現(xiàn)可視化
hic數(shù)據(jù)經(jīng)過Hic-pro處理后，會生成allvalidpairs文件齿桃，這是所有有效配對的文件惑惶。一般想要可視化的話，比較復(fù)雜短纵。這時我們就可以把它轉(zhuǎn)化為.hic文件带污，放到j(luò)u...
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幾種常用的差異分析方法簡介幾種常用的差異分析方法簡介 如今在生物學(xué)研究中，差異分析越來越普遍香到，也有許多做差異分析的方法可供選擇鱼冀。但是在實際應(yīng)用中，大多數(shù)人不知道該使用哪種方法來處理自己的數(shù)據(jù)悠就，所以今天...
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基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換前言 看了這么多期的 circos千绪，都有點乏了，換換口味也是好的梗脾。 下面荸型，咱就開始吧。 做生信分析炸茧，總是免不了要給基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換來轉(zhuǎn)換去瑞妇。 方法 一般要進(jìn)...
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整理ICGC 表達(dá)數(shù)據(jù)參考：ICGC數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)提取表達(dá)矩陣/如何提取癌癥數(shù)據(jù)--生信自學(xué)網(wǎng)使用spread 出現(xiàn)的坑--劉小澤簡書 目的：當(dāng)我們使用TCGA 表達(dá)數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)以gene-sample...
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@c50ed7bb4362 直接搜鏈接轉(zhuǎn)化梭冠，第一個就是
使用wget下載GEO數(shù)據(jù)
我們有時需要下載GEO數(shù)據(jù)辕狰，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當(dāng)我們只需要其中某一兩個文件時妈嘹。但是當(dāng)我們直接復(fù)制文件鏈接柳琢，使用wget下載時，卻只能下載當(dāng)前的網(wǎng)頁润脸。 經(jīng)過我...
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各種HIC處理數(shù)據(jù)之間的相互轉(zhuǎn)化
各種HIC處理數(shù)據(jù)之間的相互轉(zhuǎn)化 目前HI-C數(shù)據(jù)研究比較火爆柬脸，出現(xiàn)了各種各樣的工具來分析HI-C。這些工具各有優(yōu)缺點毙驯，而且對應(yīng)的有不同的下游處理工具倒堕。但這些工具的結(jié)果數(shù)據(jù)格...
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driver mutation 識別方法（部分簡介）Driver mutation 識別方法（部分）簡介 背景 眾所周知，癌癥的發(fā)生主要是由于突變的累計引起的爆价，但是癌癥細(xì)胞中有著成千上萬的突變垦巴，并不是所有突變都對腫瘤的演化具有...
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Hic-pro的結(jié)果文件轉(zhuǎn)化為.hic文件骤宣，在juicebox中實現(xiàn)可視化hic數(shù)據(jù)經(jīng)過Hic-pro處理后，會生成allvalidpairs文件序愚，這是所有有效配對的文件憔披。一般想要可視化的話，比較復(fù)雜爸吮。這時我們就可以把它轉(zhuǎn)化為.hic文件芬膝，放到j(luò)u...
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使用wget下載GEO數(shù)據(jù)我們有時需要下載GEO數(shù)據(jù)，使用getGEO的話比較麻煩形娇，特別是當(dāng)我們只需要其中某一兩個文件時锰霜。但是當(dāng)我們直接復(fù)制文件鏈接，使用wget下載時桐早，卻只能下載當(dāng)前的網(wǎng)頁癣缅。 經(jīng)過我...
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Hic-pro 的安裝
目前處理Hi-c數(shù)據(jù)的工具主要是Hic-pro和juicer。juicer相對來說更好用一些哄酝，因為更加流程化一些所灸。(具體使用方法見《HIC數(shù)據(jù)介紹及相關(guān)分析》）但鑒于Hic-...
