上一篇我們講了傳統(tǒng)venn圖的畫法金抡，今天測試另外一個包VennDetail虑凛，有點還是它綜合了upset，從而能處理大于5維的數(shù)據(jù)厂抖。 首先沒有安裝的話茎毁，安裝這個包克懊。 libra...
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IP屬地：重慶
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【R畫圖學(xué)習(xí)6.2】Venn圖---VennDetail -
cel格式的芯片原始數(shù)據(jù)處理
收到一個學(xué)生求助忱辅，得到空的表達矩陣，限于目前初學(xué)的狀態(tài)谭溉，處理原始數(shù)據(jù)比較困難墙懂，但又急用，這不扮念，我來幫忙咯损搬。 1.初步探索 表達矩陣確實是空的，不過附件里提供了cel格式的原始...
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使用R下載HPA數(shù)據(jù)庫的免疫組化數(shù)據(jù)
HPA數(shù)據(jù)庫有豐富的切片數(shù)據(jù)和免疫組化的切片柜与，可以從網(wǎng)站一個個下載保存巧勤，然后把對應(yīng)的信息保存，再重命名弄匕，再次比對信息颅悉。 但是，這樣的操作迁匠，可謂耗時耗力剩瓶，還有可能在對比的時候出...
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數(shù)據(jù)分析：RT-qPCR分析介紹 做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達是否可靠城丧。熒光定量PCR是一種相對表達定量的方法延曙，他的計算方法有很多，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析...
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TCGA的ID轉(zhuǎn)換可以一步到位了
0.背景知識 TCGA或TCGA+GTEx的表達矩陣亡哄，行名都是ensamble id枝缔，因為TCGA數(shù)據(jù)的參考基因組版本是genecode V22，xena重新分析的TCGA+...
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TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡書 [htt...
