羅列一些比較好的教程 科研星球，如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]。 百邁課爹土，系統(tǒng)進(jìn)化樹介紹及繪制...
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MegaX 軟件繪制進(jìn)化樹
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MEGA構(gòu)建進(jìn)化樹如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹_生物研究_實(shí)用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
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R語言 Logistic回歸~模型構(gòu)建
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關(guān)系。也就是說線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量熬丧。如果因變量是分類變量灭必，則是非線性的特占，此時(shí)需要用Logistic回歸理肺，對其發(fā)生概率...
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R進(jìn)行三因素方差分析歡迎關(guān)注R語言數(shù)據(jù)分析指南 本節(jié)來介紹如何使用R做三因素方差分析摄闸，繪制并排堆砌條形圖并添加顯著性字母標(biāo)記，下面來看具體例子 清理變量 安裝并加載R包 加載數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 三因...
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廣義線性混合模型（GLMM）
知識(shí)背景 廣義線性混合模型可以看做是廣義線性模型（GLM）以及線性混合模型(LMM)的擴(kuò)展妹萨，為了更好地理解GLMM年枕，肯定要對普通線性模型、廣義線性模型以及線性混合模型有個(gè)理解...
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phytools祖先狀態(tài)重建
最近做了一個(gè)祖先狀態(tài)重建的工作乎完，還是蠻有意思的熏兄。PS：需要說一下的是，RASP的祖先狀態(tài)重建主要是分布區(qū)重建树姨，用RASP的模型去做性狀重建會(huì)出現(xiàn)非常奇怪的結(jié)果摩桶，顧換成R語言來...
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多個(gè)單基因進(jìn)化樹整合成一個(gè)進(jìn)化樹通過單拷貝基因構(gòu)建物種樹，一般有兩種方法： 1娃弓，Concatenation（串聯(lián)法）：將比對完成的單個(gè)單拷貝基因依次串聯(lián)成一個(gè)超級基因（super gene/matrix）構(gòu)...
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R語言ggtree畫聚類樹圖的時(shí)候的報(bào)錯(cuò)和解決辦法
之前錄制了一起視頻介紹了使用R語言的ggtree包可視化展示層次聚類分析結(jié)果的視頻典格，最近好幾個(gè)讀者在公眾號(hào)留言畫圖的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò) Error in DataMask$new(...
