生信編程日常

今天有一個需求，就是要將gtf中的轉(zhuǎn)錄本轉(zhuǎn)成fasta序列焕盟，一開始是想著用bedtools getfasta實現(xiàn)勇皇，awk取出來坐標做成bed文件輸入bedtools，但是結(jié)果...

Y大寬

序列比對和序列特征分析總目錄 啟動子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列逮壁，調(diào)控基因表達村斟。作用方式是通過與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合。關(guān)于啟動子更詳細的簡文請看查找一個基因的啟動...

Joncc

海盜灣（The Pirate Bay怯屉，縮寫：TPB）是由瑞典的一個民間反版權(quán)組織海盜署（Piratbyr?n）成立于2003年蔚舀，最初僅為瑞典語站點。后來發(fā)展成為獨立的組織锨络，2...

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的計算赌躺，自己嘗試了分支模型和位點模型的計算，簡直不要太容易羡儿！ 更新：20190314 教程 http://wiki...

栽生物坑里的信息汪

前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)礼患、遺傳、基因組進化等的文獻掠归，其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值缅叠，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少虏冻，即使有肤粱，也只是教大家...

東風008

在線工具一般具有“功能強大庶骄、操作簡單、無需安裝践磅、用完就走”的特點单刁，輕松實現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...

顫抖吧__小蟲子

1.genome survey 數(shù)據(jù)過濾去除測序原始數(shù)據(jù)中可能包含低質(zhì)量府适、接頭污染以及含 N 過高的 reads NT比對通過BLAST對下機數(shù)據(jù)過濾后的有效數(shù)據(jù)進行 NT ...