circlize的使用：https://jokergoo.github.io/circlize_book/book/index.html[https://jokergoo.g...
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幾個最近作圖喜歡用的版式 -
R可視化：山阜玻基圖今天從別人的博客中，了解到如何更好地畫杀撕撸基圖，特記錄下該代碼湘今。 加載R包 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 合并 OTU 豐度敢朱、OTU 門水平分類、樣本分組 整理成 ggplot2 作圖格式摩瞎，以便于...
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甲基化數(shù)據(jù)和表達(dá)譜數(shù)據(jù)整合分析DNA的甲基化往往與基因的轉(zhuǎn)錄活性成反比拴签，所以DNA的甲基化程度勢必會影響基因的表達(dá)水平，進(jìn)而影響基因的功能旗们。今天我們就來看看如何將甲基化數(shù)據(jù)和基因表達(dá)水平數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析蚓哩。...
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太好用了！批量生存分析上渴，一步到位岸梨，還支持最佳截點(diǎn)~花花寫于2020-7-15喜颁。今天一口氣寫了幾個新的處理tcga數(shù)據(jù)的函數(shù)。加在tinyarray里了曹阔，1.3.1版本以上可用~當(dāng)前版本有一個小缺點(diǎn)半开，因?yàn)橛幸徊接玫搅俗址秃蛿?shù)...
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78-預(yù)測分析－Ｒ語言實(shí)現(xiàn)-嶺回歸與LASSO回歸
以上一節(jié)中未去除離群值的MSE為3619.029，修正R2為0.8603和去除離群值后的MSE為2690.545,修正R2為0.8706為基準(zhǔn)赃份，以及兩個模型在測試集上的MSE...
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用免疫風(fēng)險評分預(yù)測黑色素瘤轉(zhuǎn)移的風(fēng)險Predicting the Risk of Melanoma Metastasis Using an Immune Risk Score in the Melanoma C...
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R繪圖|ggplot2火山圖的繪制
上一期R繪圖|ggplot2散點(diǎn)圖的繪制簡單介紹了散點(diǎn)圖在高通量數(shù)據(jù)展示上的作用寂拆，以及如何繪制？散點(diǎn)圖在數(shù)據(jù)展示上存在局限抓韩，只能體現(xiàn)基因的差異幅度纠永，并不能體現(xiàn)統(tǒng)計學(xué)意義。因此...
