如何快速了解自己研究物種的同屬或者同科都有哪些物種做了基因組測(cè)序筝家? 今天遇到了這個(gè)問(wèn)題版确,首先想到NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)有專(zhuān)門(mén)的地方存儲(chǔ)都有哪些物種做了基因組測(cè)序 打開(kāi)NCBI首頁(yè)直接...
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Python+Flask安裝:http://www.reibang.com/p/cd1925e90edaFlask路徑參數(shù)以及請(qǐng)求參數(shù)講解:https://www.jian...
本節(jié)概覽:1.STRING數(shù)據(jù)庫(kù)基本介紹2.STRING R語(yǔ)言版——STRINGdb的使用:①STRINGdb數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)入 ②獲取STRING_id ③PPI繪制④clust...
CAFE: Computational Analysis of gene Family Evolution (Version 5) 參考:CAFE5 tutorial[htt...
AnnotationHub中沒(méi)有本生煙草數(shù)據(jù)庫(kù),只好自己構(gòu)建休蟹,再利用Y叔的clusterProfiler包做富集分析了者冤。首先參考非模式生物富集分析[https://mp.we...
基因家族成員鑒定的主要方法為序列相似性比對(duì)和功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)。以苦蕎的MAPK基因家族的鑒定為例徙赢。 苦蕎基因組數(shù)據(jù)處理 下載并解壓后需要使用文件如下:基因組:FtChromos...
1. 基因家族聚類(lèi) 基因家族是來(lái)源于同一個(gè)祖先字柠,由一個(gè)基因通過(guò)基因重復(fù)和物種分歧而產(chǎn)生兩個(gè)或更多的拷貝而構(gòu)成的一組基因,它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)和功能上具有明顯的相似性狡赐,編碼相似的蛋白質(zhì)產(chǎn)...
隨著基因組測(cè)序爆炸性增長(zhǎng)窑业,比較基因組學(xué)已逐漸成為每個(gè)物種尤其是首次被破譯基因組的物種的必備研究?jī)?nèi)容之一。那么什么是比較基因組學(xué)呢枕屉?比較基因組學(xué)是通過(guò)對(duì)系統(tǒng)發(fā)育中的代表性物種之...