一鉴吹、awk簡介 awk 是一種編程語言，用于在linux/unix下對文本和數(shù)據(jù)進(jìn)行處理拙寡。數(shù)據(jù)可以來自標(biāo)準(zhǔn)輸入授滓、一個或多個文件，或其它命令的輸出肆糕。支持用戶自定義函數(shù)和動態(tài)正則...
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shell命令之a(chǎn)wk
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Linux文本編輯三劍客之---awk的使用
1、awk 1.1 認(rèn)識awk awk是一種編程語言诚啃，用于在linux/unix下對文本和數(shù)據(jù)進(jìn)行處理淮摔。數(shù)據(jù)可以來自標(biāo)準(zhǔn)輸入(stdin)始赎、一個或多個文件和橙，或其它命令的輸出...
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2018-11-01GWAS實戰(zhàn)（四）plink 進(jìn)階之?dāng)?shù)據(jù)過濾數(shù)據(jù)好不好，影響到結(jié)果的準(zhǔn)確性魔招，所以我們要來對數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾晰搀，過濾前办斑，我們應(yīng)該對數(shù)據(jù)的部分特征進(jìn)行統(tǒng)計描述外恕，以此為依據(jù)來進(jìn)行過濾。 這里介紹的幾個指標(biāo)：1.individual...
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GeneFuse使用DNA數(shù)據(jù)篩查融合基因工具
工作需要鳞疲，用DNA數(shù)據(jù)直接跑融合基因，網(wǎng)上的介紹大多是用RNA轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)蠕蚜。終于發(fā)現(xiàn)一款genefuse軟件可以做到！在GitHub靶累，anaconda都有源代碼包 #軟件原網(wǎng)址：...
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Plink提取tagSNPs
Plink提取tagSNPs 1）識別haplotype block 在提取tagSNPs之前需要先識別haplotype block，這一步的代碼很多教程里都給了出來： p...
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長染色體bam索引創(chuàng)建及變異檢測
在變異檢測的所有階段尺铣，都需要對文件進(jìn)行索引，不管是輸入的基因組文件争舞，還是輸出的比對結(jié)果和變異結(jié)果文件。不同的軟件處理會生成不同的索引竞川，供后續(xù)不同的軟件使用店溢，但不可避免的會出現(xiàn)...
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男人一生有五個“關(guān)卡”要過委乌，可命苦的男人床牧，都在第三關(guān)妻離子散在現(xiàn)代社會，我們都聽過這么一句話遭贸，那就是關(guān)關(guān)難過關(guān)關(guān)過，夜夜難熬夜夜熬壕吹。 人生就是一個“過五關(guān)斬六將”的過程著蛙。不論你多有本事，當(dāng)你過了這一關(guān)之后耳贬，下一關(guān)的難題都會如約而至踏堡。 ...
