@我們一起舔過鐵欄桿 首先你確認(rèn)下你當(dāng)前使用的是gcc 4.8版本的囚灼？ gcc --version
如果不行呢蛤，你試著把R的版本調(diào)低一點(diǎn)，3.x
Linux上基于R安裝Peer包閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個包的安裝壹瘟，是因為這個包比較小眾鲫剿，帖子不多，再者我沒想到做生信這么多年稻轨，裝包無數(shù)...
mysql --user=genome -N --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D hg38 -e "select name,name...
1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合灵莲，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件。它可以接受VCF格式殴俱、壓縮的VCF格式以及BCF格式政冻，并能自動檢測輸入的格...
請教一下bcftools 怎么過濾掉太多missing samples的變異。類似于vcftools中的max-missing 操作
最全bcftools使用說明--只看本文就夠了1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合线欲，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件明场。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式李丰，并能自動檢測輸入的格...
@素瑾妍 你只要把想添加的封裝好苦锨，然后ggplot2里面通過geom_text函數(shù)添加就可以。你看我例子里面就用了兩側(cè)geom_text()趴泌，分別把公式和r2加進(jìn)去了舟舒。另外，這種其實效率也不好嗜憔，你也可以畫好圖之后用AI 編輯手動添加任何文字或者注釋信息都可以秃励。
R語言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法吉捶。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非扯嵯剩基礎(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）呐舔。按照慣例谣旁，我每次講一個...
下載源我沒有特別設(shè)置，應(yīng)該用的默認(rèn)的滋早。
Linux上基于R安裝Peer包閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個包的安裝砌们，是因為這個包比較小眾杆麸，帖子不多，再者我沒想到做生信這么多年浪感，裝包無數(shù)...
如果批量提交任務(wù)后昔头，發(fā)現(xiàn)有錯誤，想要撤回影兽，一個一個撤回太麻煩揭斧，如何批量地殺掉指定用戶所有的作業(yè)呢？只需如下一條命令就可以：qselect -u | xargs qdel
一不小心在給文件重命名的時候輸入了中文字符，結(jié)果導(dǎo)致文件名亂碼讹开，無法通過cat, less, rm 或者mv 之類的命令操作了盅视。 如何重新命名它，使得其恢復(fù)正常呢旦万？ 據(jù)說li...
在集群服務(wù)器上使用R語言，經(jīng)常會碰到很抓狂的事情成艘，那就是服務(wù)器沒連因特網(wǎng)赏半，而我們要安裝一些第三方的R包。以前寫過一篇R包的常用安裝方法(https://www.jianshu...
最近有個任務(wù)需要從基因組中提取所有的內(nèi)含子（intron）區(qū)域淆两。一開始覺得很簡單断箫，用ensembl上的biomart或者ucsc genome browser一頓猛點(diǎn)應(yīng)該就可...
閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多）仲义，之所以要寫下這個包的安裝，是因為這個包比較小眾丹莲，帖子不多光坝，再者我沒想到做生信這么多年，裝包無數(shù)...
參考：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf 描述 "freda" 用于常規(guī)分隔文...
今天讀文章碰到一個生僻的概念（只是對于我這個遺傳學(xué)學(xué)渣來說的）甥材，叫 ”narrow-sense heritability". 讀到這個的時候盯另，腦海里冒出來兩個問號：？1. h...
一般情況下我們都使用p<0.05作為閾值來拒絕原假設(shè)（零假設(shè)）洲赵。這個跟用哪個檢驗方法無關(guān)
生物學(xué)研究中常見的統(tǒng)計檢驗方法(二：Wilcoxon test)上一篇我簡單整理了t-test的用法和注意事項 （我們主要講兩個獨(dú)立隨機(jī)樣本的t-test）鸳惯。我們再回顧一下，t-test是參數(shù)統(tǒng)計檢驗方法叠萍，其應(yīng)用的假設(shè)前提是檢測變量的值服...
在NGS分析入門階段芝发，我們不需要考慮太多的細(xì)節(jié)，只用知道一個分析的大致流程并完整跑下來即可苛谷。太多的細(xì)節(jié)辅鲸，只會讓我們對于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此一些“無關(guān)緊要“細(xì)節(jié)就被我們刻...
上一篇我簡單整理了t-test的用法和注意事項 （我們主要講兩個獨(dú)立隨機(jī)樣本的t-test）。我們再回顧一下锣尉，t-test是參數(shù)統(tǒng)計檢驗方法刻炒，其應(yīng)用的假設(shè)前提是檢測變量的值服...
抱歉，annoText這里我忘記加在代碼里了自沧。它其實就是自己定義的一個data.frame. 有三列（對應(yīng)代碼中的degree,complex 和WD40id）坟奥，前兩列表示x和y坐標(biāo)值，最后一列表示對應(yīng)坐標(biāo)上的label.
R語言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法爱谁。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非成古纾基礎(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）管行。按照慣例厨埋，我每次講一個...
好像是的，可能當(dāng)時畫圖的時候annoText是在命令行控制臺上寫的捐顷，沒有放進(jìn)代碼文件里荡陷。
R語言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法迅涮。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非撤显蓿基礎(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）叮姑。按照慣例唉地，我每次講一個...
