GSEA背景 比如你讀到一篇文獻刹缝,里面的作者設(shè)計了一系列實驗庸队,其中一個實驗是者蠕,knock down基因X卿泽,對WT和KD進行RNA-seq實驗崇众,比較WT和KD的表達譜的變化择吊,從...
一促绵、什么是進化樹 系統(tǒng)發(fā)育進化樹 (Phylogenetic tree):** 一般也叫系統(tǒng)進化樹攒庵,進化樹。它可以利用樹狀分支圖形來表示各物種或基因間的親緣關(guān)系败晴。 建進化樹的...
WGCNA基礎(chǔ)概念 加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA, Weighted correlation networkanalysis)是用來描述不同樣品之間基因關(guān)聯(lián)模式的系統(tǒng)...
森嚴(yán)森語: 最近的一些學(xué)習(xí)和經(jīng)歷尖坤,讓我產(chǎn)生一種很強烈的認(rèn)知稳懒,那就是由于嚴(yán)重缺乏對身邊觸手可及的事物的了解,而導(dǎo)致在學(xué)習(xí)和生活過程中不能產(chǎn)生最大化的生產(chǎn)力慢味。常表現(xiàn)的一種具體的現(xiàn)...
目錄 背景知識1.1. 根據(jù)分析對象的分類1.2. 三個基本數(shù)據(jù)處理問題1.3. 一般分析流程1.4. 比較宏基因組學(xué)的應(yīng)用1.5. 目前存在的技術(shù)問題實驗設(shè)計2.1. 幾點...
1.背景介紹 edgeR是一個R軟件包场梆,也轉(zhuǎn)錄組差異表達分析中常用的工具,主要關(guān)注的是差異表達基因纯路,甚至可以進行無重復(fù)的差異表達分析或油。它的作用對象是readcount文件,行...