發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江西
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程僚纷，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA灶挟、samtools膝擂、gatk、Plink、Admixture、Tassel等绽乔，在此分享出來...
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公眾號(hào)：【 APP實(shí)驗(yàn)室 】折砸，歡迎關(guān)注<br>專注于發(fā)現(xiàn)好玩、好用的工具沙峻、軟件睦授。<br>wx: Ivannnnn9<br>
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Excalidraw：超好用的在線白板APP實(shí)驗(yàn)室“日更挑戰(zhàn)”，每天為你帶來一款好用摔寨、好玩的工具軟件 今天去枷，APP實(shí)驗(yàn)室推薦給大家的是一款超級(jí)好用的在線繪圖工具，Excalidraw是复。 Excalidraw：在線...
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你好删顶，我想問一下在測(cè)試rMATS時(shí)是不是使用的事他們自己的測(cè)試數(shù)據(jù)啊淑廊？他們數(shù)據(jù)的readLength不是50嘛逗余？為什么你101也能跑起來呀？不會(huì)報(bào)錯(cuò)嘛季惩？
RBP AS生信流程（ 四）rMATs
rMATs rMATs運(yùn)行： 在rMATstest這個(gè)文件夾里有官網(wǎng)下載好的2x2測(cè)試文件： 用samtools查看bam文件： 可以看到第三列為1录粱，代表1號(hào)染色體（這里是1...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生啥繁。
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@hu巴 抱歉旗闽，原作者撤了文章我也不能再傳播啦
【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學(xué)者筆記）
【CIBERSORT】超詳細(xì)蜜另，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學(xué)者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)估計(jì)分析工具适室，2015年首次發(fā)表于nature me...
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求助！如果報(bào)錯(cuò)說"there is no package called panc8.SeuratData"該怎么辦啊
SeuratData||你需要的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析實(shí)例數(shù)據(jù)合集
SeuratData是一種使用R的內(nèi)部包和數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)以Seurat對(duì)象的形式分發(fā)數(shù)據(jù)集的機(jī)制蚕钦。它代表了一種方便用戶訪問Seurat中使用的數(shù)據(jù)集的方法亭病。 我們創(chuàng)建了seur...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個(gè)R包，可以用來做各種富集分析嘶居，如GO罪帖、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）邮屁、Reacto...
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教你畫一個(gè)掰彎的熱圖（Heatmap）整袁，展示更多的基因表達(dá)量難道，這不像孔雀開屏嗎佑吝？ 寫在前面 組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫坐昙，但是信息的挖掘仍任重道遠(yuǎn)。順手的工具芋忿，可以節(jié)省使用者盡可能多的時(shí)間炸客，或者將看起來很復(fù)雜疾棵，很難以完成的事情，變得非常簡(jiǎn)單痹仙。...
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@鄭寶童 謝謝呀~
[R]用R執(zhí)行cibersort开仰，根據(jù)組織的基因表達(dá)譜獲取細(xì)胞的百分比
CIBERSORT is an analytical tool developed by Newman et al. to provide an estimation of ...
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【CIBERSORT】超詳細(xì)拟枚，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學(xué)者筆記）【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學(xué)者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)估計(jì)分析工具众弓，2015年首次發(fā)表于nature me...
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你們都是善良的人
