GO富集介紹每個(gè)基因都會(huì)對(duì)應(yīng)有一個(gè)或多個(gè)GO term(也就是GO功能)劫哼。富集涉及到兩個(gè)概念:前景基因和背景基因蒋院。前景基因就是你關(guān)注的要重點(diǎn)研究的基因集祭示,背景基因就是所有的基...
IP屬地:山東
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歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! Gene Ontology是研究基因功能的重要數(shù)據(jù)庫之一闲先,在進(jìn)行GO的富集分析時(shí)差油,需要提供所有基因?qū)?yīng)的GO注釋信息驶冒,本文介紹幾種獲取該信息的方式...
what is Gene Ontology ?——基因本體論 1 再扭, 什么是本體論氧苍?簡單來說,就是我們對(duì)一個(gè)具體事物進(jìn)行分類并予以描述泛范。例如:貓是一種哺乳動(dòng)物/貓是貓科動(dòng)物/...
前言 pathview是一個(gè)通路可視化友好的R包让虐,最主要的是它支持多組學(xué)數(shù)據(jù)映射(基因/蛋白-代謝)。自己用過它的R包罢荡,后來發(fā)現(xiàn)有網(wǎng)頁版的赡突,果斷介紹給學(xué)員。因?yàn)椴怀S们裕涗浺?..
g:Profiler主要有四個(gè)可選工具: g:GOSt用于分析 flat or ranked gene lists以獲得富集特征惭缰; g:Conver用于轉(zhuǎn)換不同類別的基因標(biāo)識(shí)...