![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/1-04bbeead395d74921af6a4e8214b4f61.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
找到Matrix eQTL這個包焚碌,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations(...
請問博主有更好的辦法么罢绽,我跑了下代碼畏线,只匹配了很少一部分
無痛解決基因全稱與縮寫的轉(zhuǎn)換“山窮水盡疑無路,柳暗花明又一村” 某天良价,想收集一類藥物的作用靶點寝殴,上了Drugbank獲取了全部數(shù)據(jù)蒿叠,加載到R中,解析出來后蒙圈了蚣常,它居然一個基因靶點對應(yīng)了多個名稱市咽。這就很...
@ScorpioGirll 好的施绎,現(xiàn)在了解啦,謝謝贞绳!
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期待后續(xù)!
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“臨床表型轉(zhuǎn)換為數(shù)值的trait的時候押蚤,直接涉及到了后面相關(guān)性的計算:”所以想請教一下,是不是比如不同疾病羹应,就其他分類變量就改成1和0就好揽碘,可以改成10或0么,或100與0园匹,這樣會影響相關(guān)性結(jié)果么雳刺,謝謝您!
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寫在前面枪汪,這篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
The Connectivity Map, or CMap, is a resource that uses cellular responses to perturbati...
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代碼矮烹,實現(xiàn)了導(dǎo)出gene2module 目的 最近有個項目又準(zhǔn)備跑WGCNA越庇,之前跑通過一個奋隶,然后很久沒碰,...
主要簡單總結(jié)省心的工具悦荒,具體用的時候再查就好唯欣。 替換功能 善用星號(*),問號(搬味?)境氢,連接文本(&)示例:有兩個大組數(shù)據(jù),每組數(shù)據(jù)均有兩列碰纬,對其整體取交集萍聊,各組兩列分別為;"...
本來覺得轉(zhuǎn)錄組上游暫時先不用學(xué)習(xí)亭螟,但是在處理原始數(shù)據(jù)時候,發(fā)現(xiàn)下載后骑歹,需批量處理樣本预烙,解壓縮,及修改文件名道媚。批量處理扁掸?欸,可以用LINUX最域,去百度了以下方法谴分,待更新; 繼續(xù)百...