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理解autodock分子對(duì)接思路和流程
總結(jié) 準(zhǔn)備工作： 設(shè)置工作目錄，用pymol去除水分子，分離蛋白和小分子，得到各自的pdb文件。 （如果是預(yù)測(cè)得到的蛋白pdb，那就直接拿來(lái)用咯...
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分子對(duì)接沒(méi)搞明白的地方：gridbox的設(shè)置以下是查到的資料愁溜，目前似懂非懂。關(guān)于對(duì)接盒子的設(shè)置 是分子對(duì)接的一個(gè)重要參數(shù)外厂。分子的大小可以通過(guò)回轉(zhuǎn)半徑Rg有效地描述冕象，Rg是廣泛使用的分子尺寸...
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10分鐘獲得小分子三級(jí)結(jié)構(gòu)(.pdb)開(kāi)心，打開(kāi)公眾號(hào)后臺(tái)竟然有700粉絲咯汁蝶，感謝大家的關(guān)注和分享渐扮，公眾號(hào)日更永不斷~~~ 獲得本文所需軟件：在生信星球公眾號(hào)(文末有二維碼)后臺(tái)回復(fù)...
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蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)论悴、結(jié)果解讀與評(píng)分蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做墓律，不限物種膀估，沒(méi)有太多要求，可為文章增色耻讽。windows版本的VMD軟件可在公眾號(hào)生信星球回...
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Autodock分子對(duì)接完結(jié)&總結(jié)1.Grid （1） 打開(kāi)蛋白察纯，“Grid->Macromocule->Open”，打開(kāi)“r.pdbqt”针肥。彈出的對(duì)話框饼记，點(diǎn)擊Yes及確定 （2...
