一赫舒、基本概念 方差分析（analysis of variance）用于研究一個或多個分類型自變量與一個數(shù)值型因變量的關(guān)系挑豌。方差分析通過檢驗多個總體的均值是否相等來判斷一個或多...
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方差分析（analysis of variance）基本概念 -
統(tǒng)計方法的選擇（1）--正態(tài)性和方差齊性將“二八法則”運用到我們的統(tǒng)計學(xué)習中奈搜，就是用20%的時間精力去習得最重要最常用80%的技巧和能力。統(tǒng)計學(xué)的東西很多很繁雜鄙麦，如果面面俱到的話典唇，精力不夠，時間不足胯府，還不一定能用的...
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GWAS之表型最優(yōu)無偏預(yù)測（BLUP)與遺傳力計算表型分析之最優(yōu)無偏預(yù)測 最佳線性無偏預(yù)測（Best Linear Unbiased Prediction介衔，簡稱BLUP）可以對多環(huán)境數(shù)據(jù)進行整合，去除環(huán)境效應(yīng)盟劫，得到個體穩(wěn)定遺...
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GWAS顯著性閾值設(shè)置
Bonferroni校正P值：0.05/n夜牡，n為SNP個數(shù)。Bonferroni校正P值是最嚴格的多重檢驗校正方法侣签，假設(shè)每次檢驗為獨立事件，因此除以n急迂。 《Associati...
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基因表達分析（上）- 差異表達分析基因表達 什么是基因表達影所，如下是來自于維基百科的解釋： 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂，所以就放幾段百度百科和維基百科的定義僚碎。 百度百科 定量PCR（即時聚合酶鏈鎖反應(yīng)...
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最大似然估計（ML）和REML
A.F. Zuur et al., Mixed Effects Models and Extensions in Ecology with R, p116-119, chr ...
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數(shù)學(xué)基礎(chǔ) | 協(xié)方差勺阐，協(xié)方差矩陣卷中，方差-協(xié)方差矩陣
一、協(xié)方差 什么是協(xié)方差 當X=Y渊抽，協(xié)方差就是方差 協(xié)方差有什么含義 協(xié)方差反應(yīng)兩個變量在變化過程中是同方向變化還是反方向變化蟆豫，以及同向或反向程度如何。協(xié)方差為正懒闷，說明兩個變...
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ggpubr包學(xué)習筆記之輕松修改圖形參數(shù)簡介 越學(xué)習包ggpubr越感覺其功能強大十减，本文主要講解一下如何修改圖形參數(shù)，我們知道ggplot2有著十分強大的繪圖功能愤估，但是其參數(shù)之復(fù)雜足以讓人望而卻步帮辟。ggpubr提供...
