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  • 請(qǐng)問(wèn)SNP數(shù)據(jù)怎么計(jì)算其遺傳距離呢摊欠,如Nei,Roger等

    群體遺傳學(xué)之個(gè)體間遺傳距離及其計(jì)算方法

    01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...

  • PCA需要對(duì)snp進(jìn)行LD過(guò)濾嗎丢烘?

    主成分分析

    數(shù)據(jù)過(guò)濾質(zhì)控之后 PCA分析(gcta) 利用R繪圖

  • 所有的分析都需要對(duì)snp進(jìn)行LD過(guò)濾嗎?還是只有PCA不需要些椒?

    2021.11.19 | 群體遺傳結(jié)構(gòu)播瞳、PCA、進(jìn)化樹(shù)

    常見(jiàn)的群體結(jié)構(gòu)的分析方法有admixture分析免糕、系統(tǒng)發(fā)生數(shù)分析以及主成分分析等赢乓。 1、admixture分析 1)R語(yǔ)言繪圖 admixture的可視化分為兩種 2)pon...

  • 我想問(wèn)的是文章里的perl .sh腳本可以分享在哪獲取嗎??

    9.2 GWAS:關(guān)聯(lián)分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出現(xiàn)的用于動(dòng)植物關(guān)聯(lián)分析的軟件币喧,還可以對(duì)進(jìn)化模式以及連鎖不平衡進(jìn)行評(píng)估轨域,功能非常強(qiáng)大,要說(shuō)缺點(diǎn)杀餐,可能就是真的有點(diǎn)慢干发。 表型數(shù)據(jù)處理在下面這篇帖子中有介紹,這...

  • 腳本可以分享嗎

    9.2 GWAS:關(guān)聯(lián)分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出現(xiàn)的用于動(dòng)植物關(guān)聯(lián)分析的軟件史翘,還可以對(duì)進(jìn)化模式以及連鎖不平衡進(jìn)行評(píng)估枉长,功能非常強(qiáng)大,要說(shuō)缺點(diǎn)琼讽,可能就是真的有點(diǎn)慢必峰。 表型數(shù)據(jù)處理在下面這篇帖子中有介紹,這...

  • 又一大佬飛升而去,我輩望塵莫及拔是贰肝匆!

    停更

    本想注銷(xiāo)賬號(hào)粒蜈,后來(lái)隨便翻了翻,還是沒(méi)舍得术唬。簡(jiǎn)書(shū)曾讓我投入了很多感情薪伏,碼文章也占用了我很多時(shí)間滚澜,就像自己養(yǎng)大的花一樣粗仓,不是隨便就能掐死的。停更大概一年了设捐,主要原因是認(rèn)識(shí)到自己有...

  • Python小試牛刀之爬取本地城市新房?jī)r(jià)格和地址

    利用xpath解析數(shù)據(jù)借浊,requests庫(kù)爬取房?jī)r(jià),大致步驟如下: 獲得目標(biāo)網(wǎng)址萝招,并觀(guān)察網(wǎng)址源碼蚂斤; UA偽裝,請(qǐng)求并獲得響應(yīng)槐沼; 解析標(biāo)簽數(shù)據(jù)曙蒸; 循環(huán)遍歷提取解析到的數(shù)據(jù),并保...

  • 大佬這個(gè)shinyapp怎么打包成本地應(yīng)用的兼吓?

    Qplottools分析畫(huà)圖工具(本地版)

    以前一直在維護(hù)一些R寫(xiě)的畫(huà)圖工具(www.qplot.cn)臂港,由于服務(wù)器的配置原因 ,訪(fǎng)問(wèn)速度很慢视搏,上傳大點(diǎn)的數(shù)據(jù)可能就會(huì)斷線(xiàn)审孽,用的人也不是很多,計(jì)劃2020.7月服務(wù)器到期...

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R語(yǔ)言小白一枚浑娜,遺傳育種專(zhuān)業(yè)佑力,不定期更新學(xué)習(xí)筆記。
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