網(wǎng)頁(yè)上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多诫给,對(duì)自己這個(gè)生信小白來(lái)說(shuō)比較簡(jiǎn)單通俗易懂的當(dāng)數(shù)生信寶典和生信技能樹(shù)的教程了。感謝大佬們的付出费坊。下面是自己整理的個(gè)人學(xué)習(xí)筆記颤枪,可能有理解不對(duì)...
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前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時(shí)看看它們的功能,需要做個(gè)富集分析。雖然公司買(mǎi)了最新版的數(shù)據(jù)庫(kù)芒篷,如KEGG搜变,但在集群跑下來(lái)嫌麻煩。這時(shí)網(wǎng)頁(yè)在線或者本地化工具派上用場(chǎng)了针炉。...
知道這本書(shū)是一個(gè)偶然的機(jī)會(huì)挠他,那段時(shí)間正好在研究免疫細(xì)胞比較厲害的團(tuán)隊(duì)工作(忝列門(mén)墻啊)篡帕,自然想找點(diǎn)資料來(lái)擴(kuò)充一下自己的知識(shí)面殖侵,以便知道T細(xì)胞到底有幾個(gè)正宗的亞群。如張老師對(duì)T...
前一陣子練習(xí)了幾個(gè)單細(xì)胞測(cè)序分析镰烧,然而對(duì)于所用的R包并沒(méi)有深入的學(xué)習(xí)拢军。作為強(qiáng)迫癥晚期患者,想知其然怔鳖,還想知其所以然茉唉,所以打算仔細(xì)的學(xué)習(xí)這些R包的使用。這篇文章將深入的學(xué)習(xí)Mo...
monocle做擬時(shí)序分析首先要構(gòu)建CDS需要3個(gè)矩陣:expr.matrix结执、pd度陆、fd,其次將Seurat中的對(duì)象轉(zhuǎn)換為monocle識(shí)別的對(duì)象昌犹。然后選擇想要做擬時(shí)序依據(jù)...
1.寫(xiě)在前面的話: 近年來(lái)坚芜,由于細(xì)胞的異質(zhì)性及發(fā)育分化等相關(guān)的問(wèn)題越來(lái)越被研究者們所關(guān)注,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析為研究異質(zhì)細(xì)胞群的復(fù)雜生物學(xué)過(guò)程提供了方法和工具斜姥。每一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄...
在前面盲人摸象--single cell sequencing的Seurat學(xué)習(xí)--詳細(xì)版這篇文章之后鸿竖,我膨脹了!感覺(jué)好想好想學(xué)習(xí)铸敏,因此缚忧,依據(jù)之前閱讀單細(xì)胞文獻(xiàn)的經(jīng)歷,將自己...
筆記內(nèi)容:用ggplot2繪制scatterplot with confidence ellipsesenvfit的R實(shí)現(xiàn)及釋意用ggpubr繪制scatterplot wi...