網(wǎng)頁上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多虐秦,對自己這個生信小白來說比較簡單通俗易懂的當數(shù)生信寶典和生信技能樹的教程了。感謝大佬們的付出悦陋。下面是自己整理的個人學習筆記蜈彼,可能有理解不對...
前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時看看它們的功能还绘,需要做個富集分析栖袋。雖然公司買了最新版的數(shù)據(jù)庫拍顷,如KEGG,但在集群跑下來嫌麻煩昔案。這時網(wǎng)頁在線或者本地化工具派上用場了尿贫。...
知道這本書是一個偶然的機會踏揣,那段時間正好在研究免疫細胞比較厲害的團隊工作(忝列門墻啊)捞稿,自然想找點資料來擴充一下自己的知識面又谋,以便知道T細胞到底有幾個正宗的亞群。如張老師對T...
前一陣子練習了幾個單細胞測序分析搂根,然而對于所用的R包并沒有深入的學習铃辖。作為強迫癥晚期患者剩愧,想知其然,還想知其所以然娇斩,所以打算仔細的學習這些R包的使用。這篇文章將深入的學習Mo...
monocle做擬時序分析首先要構(gòu)建CDS需要3個矩陣:expr.matrix、pd鉴分、fd,其次將Seurat中的對象轉(zhuǎn)換為monocle識別的對象志珍。然后選擇想要做擬時序依據(jù)...
1.寫在前面的話: 近年來,由于細胞的異質(zhì)性及發(fā)育分化等相關(guān)的問題越來越被研究者們所關(guān)注伦糯,單細胞轉(zhuǎn)錄組分析為研究異質(zhì)細胞群的復(fù)雜生物學過程提供了方法和工具柜某。每一個細胞進行轉(zhuǎn)錄...
在前面盲人摸象--single cell sequencing的Seurat學習--詳細版這篇文章之后喂击,我膨脹了!感覺好想好想學習载慈,因此惭等,依據(jù)之前閱讀單細胞文獻的經(jīng)歷,將自己...
筆記內(nèi)容:用ggplot2繪制scatterplot with confidence ellipsesenvfit的R實現(xiàn)及釋意用ggpubr繪制scatterplot wi...