目錄 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用說明1.3 使用實例 bigwigCompare 工具2.1 使用說明2.2 使用實例 前言 今天主要介紹下...
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deeptools工具系列——比較不同bw_bam的信號差異 -
kmer分析的幾款軟件介紹1.jellyfish 運行jellyfish 2.使用 GCE 進(jìn)行基因組大小評估 GCE 軟件包中主要包含 kmer_freq_hash 和 gce 兩支程序。前者用于進(jìn)...
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基因組比對及T2T kmer可視化軟件---RAviz功能介紹老規(guī)矩虚倒，先和同學(xué)們介紹一下為什么要做這么一款軟件诊笤？基因組比對paf格式文件： 當(dāng)同學(xué)們需要進(jìn)行基因組層面的序列比較時系谐，通常要面對如上所示的比對結(jié)果文件，這個文件可能有幾十萬甚...
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TBtools | 基因組重測序數(shù)據(jù)分析常用上游軟件「三兄弟」盏混，聚齊了~寫在前面 是的蔚鸥，最后，我選擇了「一條路走到黑」~ 咱們先不管一些人如何看许赃，東西先整出來止喷。大體如下。 沒錯混聊。從「原始測序數(shù)據(jù)」到「SNP Calling」弹谁，也就是 從 .fas...
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SCAU Class | 課程作業(yè)「基因家族分析」流程參考作業(yè)要求 提供一份分析報告，可以以學(xué)術(shù)論文格式撰寫句喜，包含以下部分 選定物種與目標(biāo)基因家族的原因 家族成員主要特征介紹（基于廣泛文獻(xiàn)檢索) 物種基因組序列與注釋信息獲取 基于 ...
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ggtree 兩個進(jìn)化樹之間連線https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter2.html[https://yulab-smu.top/treedata-book/c...
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等位基因特異性表達(dá)(ASE)及順反式調(diào)控研究的相關(guān)分析整理
在對動植物雜交種（或F1子代）的基因組和轉(zhuǎn)錄組的關(guān)聯(lián)研究中预愤，要回答這么一個問題：基因組變異到底與基因表達(dá)有什么關(guān)系？ 這個問題很難咳胃，因為涉及影響基因表達(dá)調(diào)控的因素可太多了植康！多...
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用 shapiro.test() 函數(shù)進(jìn)行正態(tài)性檢驗，樣本數(shù)目過多報錯
shapiro.test() 在 R 中有一個限制存崖，它最多只能應(yīng)用于大小為 5000 的樣本冻记，并且最小樣本大小必須為 3。 因此来惧，我們有一個替代假設(shè)檢驗冗栗，稱為 Anderso...
