IP屬地：北京
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CIDP---啟動(dòng)子容诬，基因全長(zhǎng)以及CDS序列提取因?yàn)镃IDP需要目的序列匙监，對(duì)于沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說從基因組提取序列是一個(gè)相對(duì)痛苦的過程斯碌。所以給同學(xué)們?cè)O(shè)置了序列提取模塊瑞躺。請(qǐng)同學(xué)們進(jìn)行軟件安裝以...
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CIDP---為sgRNA/guide RNA設(shè)計(jì)引物基本過程是設(shè)計(jì)完sgRNA后需要將sgRNA插入到載體序列中靶草，這個(gè)時(shí)候就涉及到了插入哪個(gè)位點(diǎn)的問題雨膨。因?yàn)橥瑢W(xué)們手中可能有各種各樣的載體，所以在這...
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CIDP---CRISPR sgRNA設(shè)計(jì)模塊各位老師扔茅、同學(xué)已旧，大家好，今天向大家推出一款我最新開發(fā)的召娜、用于CRIPSR系統(tǒng)中sgRNA設(shè)計(jì)的軟件运褪，CIDP。 還是老規(guī)矩玖瘸，首先向同學(xué)們介紹為什...
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基因組比對(duì)及T2T kmer可視化軟件---RAviz功能介紹老規(guī)矩秸讹，先和同學(xué)們介紹一下為什么要做這么一款軟件？基因組比對(duì)paf格式文件： 當(dāng)同學(xué)們需要進(jìn)行基因組層面的序列比較時(shí)雅倒，通常要面對(duì)如上所示的比對(duì)結(jié)...
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GFAP---pfam_go_kegg模塊后來發(fā)現(xiàn)璃诀，即便努力實(shí)現(xiàn)了各科代表物種的注釋，但在某些情況下還是直接注釋可能更方便些蔑匣。于是對(duì)GFAP添加了一個(gè)新的模塊劣欢，該模塊直接用pfam, G...
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GFAP---關(guān)于版本的漢化
早年用一些外國(guó)軟件的時(shí)候總是希望能夠找到漢化版本，到自己做軟件了裁良，反而忽視了這個(gè)問題凿将。既然本照著為同學(xué)們解決問題的原則，今天終于將GFAP進(jìn)行了...
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GFAP---Gene family模塊嗯价脾，與上一章（GFAP---Transcription factor）的基本操作相同牧抵，不浪費(fèi)同學(xué)們寶貴的時(shí)間了。區(qū)別點(diǎn)在于侨把，該模塊所針對(duì)是非轉(zhuǎn)錄...
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GFAP---Transcription factor模塊對(duì)于一些沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說犀变，想要從一堆未知功能的基因中挑選出想要的轉(zhuǎn)錄因子，可能還要花費(fèi)大量的時(shí)間成本去學(xué)習(xí)這個(gè)過程座硕。而轉(zhuǎn)錄因子又在植物中起...
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GFAP---KEGG analysis模塊該模塊主要用于KEGG分析以及作圖弛作。首先，需要得到相應(yīng)基因的KEGG以及KO IDs: 輸入文件是先前的比對(duì)文件华匾，選擇近緣物種映琳，然后保存并命名，...