甲基化的C在重亞硫酸鹽的作用下不會轉化為U/T;
非甲基化的C在重亞硫酸鹽的作用下才轉化為U/T碎赢;
您這第一步是不是有點不恰當秒裕??枚碗?
BS-seq及bismark原理ref1:一個非常好的bsseq講義: 點擊在線看bsseq講義 ref2:Whole-Genome Bisulfite Sequencing --illumina ref3...
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和我觀察的不大一樣
轉載soft clip & hard clip in CIGARhttp://www.cnblogs.com/leezx/p/6105646.htmlclipped alignment因為著在比對過程中肮雨,并沒有用到全部的read的序列遵堵,r...
Python 高效編程小技巧 個人博客:臨風|刀背藏身Python 一直被我拿來寫算法題,小程序怨规,因為他使用起來太方便了陌宿,各種niubi閃閃的技能點也在寫算法的過程中逐漸被挖...
有文獻支持BS-seek2 比bismark的比對效果更好嗎霜瘪?
全基因組甲基化分析簡述DNA甲基化是一種非持椴澹基礎且重要的表觀修飾,在調控基因表達颖对、轉錄因子結合和抑制轉座子元件中起到關鍵的作用捻撑。 目前,DNA甲基化檢測的技術已經比較成熟缤底,例如高通量的WGBS顾患、R...
在UNIX/Linux中徙歼,經常需要寫腳本執(zhí)行自動化工作犁河。執(zhí)行腳本有多種方式,可以通過sh魄梯,source或者exec桨螺。這些方式有一些區(qū)別,需要根據需求選擇合適的方式酿秸。 sh方式...
作者:ouyangyewei個人站點:http://blog.csdn.net/yeweiouyang 1. 基礎知識準備 1.1. linux后臺進程 Unix是一個多任務...
你好灭翔,能把文件按照指定行區(qū)間分割后并行讀取嗎
python多線程多進程讀取大文件支持python2.7 3.5 3.6, 運用multiprocessing模塊的Pool 異步進程池,分段讀取文件(文件編碼由chardet自動判斷辣苏,需pip insta...
支持python2.7 3.5 3.6, 運用multiprocessing模塊的Pool 異步進程池考润,分段讀取文件(文件編碼由chardet自動判斷狭园,需pip insta...
原理我們已經在前文中討論過了,這次主要是代碼實戰(zhàn) 1. 定義一個數據集 2. PCA主函數 3. 選出值最高的兩個PC 我們在PCA原理部分已經講過了糊治,十個樣本唱矛,會產生10...