發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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將數(shù)據(jù)集中一個(gè)CELL拆成多行或反過(guò)來(lái)
一晒屎、將一個(gè)CELL的一行轉(zhuǎn)成多行 在做數(shù)據(jù)清洗時(shí)腋寨，有時(shí)會(huì)遇到一個(gè)cell中是很多個(gè)逗號(hào)隔開(kāi)的數(shù)據(jù)酿雪，也就是一對(duì)多的情況鸣哀，而我們需要將其轉(zhuǎn)為每一行是...
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用topGO進(jìn)行GO富集分析topGO是一個(gè)半自動(dòng)的GO富集包违霞，該包的主要優(yōu)勢(shì)是集中了好幾種統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的方法，目前支持的統(tǒng)計(jì)方法如下： 一、安裝 BiocManager::i...
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用blast進(jìn)行本地化搜索PHI數(shù)據(jù)庫(kù)
PHI（pathogen host interactions）是一個(gè)病原菌和宿主互作的數(shù)據(jù)庫(kù)牵咙，包含了許多已報(bào)道的病原菌致病相關(guān)基因的信息。網(wǎng)頁(yè)版...
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轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因分析基本流程（上）
入門(mén)而已攀唯，主要是為了熟悉轉(zhuǎn)錄組分析的基本流程洁桌，得到差異表達(dá)基因，所以在數(shù)據(jù)上選擇了比較小的單端測(cè)序數(shù)據(jù)侯嘀，同時(shí)也不考慮論文出處另凌，僅簡(jiǎn)單分析數(shù)據(jù)。數(shù)...
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GO富集分析GO富集是組學(xué)數(shù)據(jù)分析常用的手段戒幔，通常用來(lái)挖掘差異基因中GO term的富集程度吠谢。Fisher's exact test是常用的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法，但...
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GO文件中的注釋信息是如何得到的
一直很好奇GO注釋文件中的信息是如何得到的诗茎，終于在《The Gene Ontology Handbook》中找到了答案工坊。GO的原始文件可以分為兩...
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基因本體論一、什么是生物學(xué)功能 根據(jù)Paul D. Thomas的說(shuō)法敢订，現(xiàn)在關(guān)于什么是生物學(xué)功能的討論主要有兩種："causal role functio...
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本體論是什么
Dispite this popularity and widespread use, many aspects of the Gene Ont...
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Phylogenetic tree——系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建具體構(gòu)建發(fā)育樹(shù)的軟件非常多王污，這里主要使用R軟件中的tidytree, treeio和ggtree包來(lái)進(jìn)行數(shù)據(jù)整合、操作和圖像繪制(https:y...