一齐婴、將一個(gè)CELL的一行轉(zhuǎn)成多行 在做數(shù)據(jù)清洗時(shí)，有時(shí)會(huì)遇到一個(gè)cell中是很多個(gè)逗號(hào)隔開的數(shù)據(jù)稠茂，也就是一對(duì)多的情況，而我們需要將其轉(zhuǎn)為每一行是一對(duì)一的格式睬关，這時(shí)可用iter...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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將數(shù)據(jù)集中一個(gè)CELL拆成多行或反過(guò)來(lái)
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用topGO進(jìn)行GO富集分析topGO是一個(gè)半自動(dòng)的GO富集包诱担，該包的主要優(yōu)勢(shì)是集中了好幾種統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的方法电爹，目前支持的統(tǒng)計(jì)方法如下： 一蔫仙、安裝 BiocManager::install('topGO')...
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用blast進(jìn)行本地化搜索PHI數(shù)據(jù)庫(kù)
PHI（pathogen host interactions）是一個(gè)病原菌和宿主互作的數(shù)據(jù)庫(kù)摇邦，包含了許多已報(bào)道的病原菌致病相關(guān)基因的信息。網(wǎng)頁(yè)版的PHIB-blast只能支持...
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轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因分析基本流程（上）
入門而已屎勘，主要是為了熟悉轉(zhuǎn)錄組分析的基本流程施籍，得到差異表達(dá)基因概漱，所以在數(shù)據(jù)上選擇了比較小的單端測(cè)序數(shù)據(jù)丑慎，同時(shí)也不考慮論文出處瓤摧，僅簡(jiǎn)單分析數(shù)據(jù)竿裂。數(shù)據(jù)來(lái)源：Accession n...
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GO文件中的注釋信息是如何得到的
一直很好奇GO注釋文件中的信息是如何得到的，終于在《The Gene Ontology Handbook》中找到了答案这嚣。GO的原始文件可以分為兩部分：ontology和ass...
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Phylogenetic tree——系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建具體構(gòu)建發(fā)育樹的軟件非常多，這里主要使用R軟件中的tidytree, treeio和ggtree包來(lái)進(jìn)行數(shù)據(jù)整合罐旗、操作和圖像繪制(https:yulab-smu.github...
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Phylogenetic tree——系統(tǒng)發(fā)育樹的生成有人說(shuō)生命科學(xué)的所有問(wèn)題的答案都應(yīng)該到進(jìn)化里尋找，還有人說(shuō)不懂進(jìn)化的生命科學(xué)家是耍流氓九秀。 系統(tǒng)發(fā)育樹或進(jìn)化樹是一種常用來(lái)表示物種宗譜親緣關(guān)系的樹狀結(jié)構(gòu)圖遗嗽。在分子水平，親緣關(guān)系...
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Mothur分析Illumina微生物組數(shù)據(jù)（一）
數(shù)據(jù)來(lái)源：Development of a dual-index sequencing strategy and curation pipeline for analyzin...
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UniFrac distance物種多樣性的指標(biāo)：alpha diversity: 衡量一個(gè)集合體或一個(gè)環(huán)境中物種的多樣性痹换。beta diversity:衡量群落之間的差別，是生態(tài)系之間的種的多樣性都弹。gam...
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The rent of emerald-the price of house on seattle AirBNBSeattle is a seaport city on the West Coast of the United States. The city is situated ...
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缺而不失——pandas中常見缺失值處理方法缺失值的處理是一件藝術(shù)活系羞，最高的境界應(yīng)該是缺而不失。pandas中提供了非常豐富的工具來(lái)對(duì)缺失值進(jìn)行處理霸琴。這里主要是對(duì)常用方法的簡(jiǎn)要介紹。 注：不同地區(qū)和軟件對(duì)缺失值的表示方...
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研究生入坑只見森林不見樹木每個(gè)入坑的研究生幾乎都是從看綜述開始的梧乘，在確定好研究課題后的第一件是也許就是看各種綜述。如果把綜述看成一顆樹庐杨，那么順著這顆樹的脈絡(luò)选调，我們可以清楚地看到這個(gè)小領(lǐng)域的研究方向和進(jìn)...
