16SrRNA 基因通常作為分子標記進行微生物群落結(jié)構的研究，但是它有一些明顯的限制琉挖，比如16S rRNA基因在物種中會有多個拷貝贞奋，而且橘原，由于16S rRNA基因的進化速率較...
發(fā)簡信
IP屬地：內(nèi)蒙古
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Fungene分析流程比較以nifH為例 -
常用生物信息學分析在線網(wǎng)址生物信息學分析和作圖是科研狗們的必備技能。近幾年，隨著數(shù)據(jù)類型的增多，excel迫悠、SPSS等常用軟件已經(jīng)不能滿足科研需求了。R語言以其方便溯壶、快捷的優(yōu)勢及皂，迅速獲得許多編程技術不...
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OrthoFinder2—同源蛋白家族聚類尋找同源蛋白家族用的比較多的是Orthomcl甫男，但是該軟件多年前已經(jīng)停止更新且改，且使用的時候需要安裝和使用MySQL，操作起來比較繁瑣板驳。因此OrthoFinder應運而...
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生物信息中的Python 01 | 從零開始處理基因序列
一又跛、 序列數(shù)據(jù)的下載 在開始了解序列的處理流程時，我們先要知道序列下載網(wǎng)址若治。其中一個知名的網(wǎng)站就是NCBI （National Center for Biotechnolog...
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R-ggplot2-說說繪圖中顏色的這點事-應該是比較全的總結(jié)篇0. 問題導入 之前繪圖的時候慨蓝，我經(jīng)常會去RGB顏色對照表[https://tool.oschina.net/commons?type=3]上手動去摘選顏色碼，然后手動粘到g...
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相關性分析及可視化R筆記近日端幼，因宿舍小趙同學看文章礼烈，看到一張關于相關性分析結(jié)果可視化的圖表，并對其表達含義表示了百思不得其解婆跑，于是在我們的男神428宿舍引發(fā)了一波生信小熱潮此熬。可能對于大佬們來說這是很...
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R數(shù)據(jù)可視化11:相關性圖之前我們用熱圖的形式展現(xiàn)了相關關系滑进，今天我們來用另外幾種形式來展現(xiàn)相關關系的圖犀忱。本文代碼來源：Visualize correlation matrix using corre...
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公眾號：“生信補給站”<br>生物信息學 R語言 Python語言
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不做無條件咨詢，見諒
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R：堆疊圖铜异、沖積圖哥倔、分組分面、面積圖導讀 宏基因組分析分為物種分析和功能分析兩大塊熙掺。物種組成分析是物種分析中最基本最常見的分析方法未斑。利用R語言堆疊圖，我們可以將一個項目中所有樣品的物種組成展示出來币绩。下面介紹如何...
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北京基因組所研究生在讀，實驗&生信小蝸牛一只芽突。歡迎一起討論呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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16S測序分析（二）菌群多樣性分析導讀 多樣性分析是16S測序分析中常見的分析方法试浙。本文旨在向初學者介紹多樣性分析中alpha多樣性和beta多樣性的由來、概念寞蚌、計算田巴，以及展示“如何用R語言實現(xiàn)alpha多樣...
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微信小程序“了塵蘭若的小坑”壹哺，公眾號“生信之巔”都可以找到我。
