MiSeq測(cè)16S文庫(kù)時(shí)朝刊，為什么要加PhiX? 測(cè)定混合微生物群的16S的若干個(gè)片段，從其可變區(qū)的序列來(lái)進(jìn)行菌落組成分序负懦，已是很常用的實(shí)驗(yàn)方法。 自從MiSeq測(cè)序平臺(tái)推出P...
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MiSeq測(cè)16S文庫(kù)時(shí)骑歹，為什么要加PhiX?（轉(zhuǎn)）
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conda下多版本Python切換和配置
1.問(wèn)題 學(xué)習(xí)Python是目前十分火熱的一個(gè)領(lǐng)域持搜，但是Python3和Python2之間的切換和選擇經(jīng)常使人煩惱密似，多版本的Python之間經(jīng)常會(huì)有沖突。解決這一問(wèn)題的一個(gè)好...
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STEP3:了解參考基因組及注釋文件下載原始測(cè)序數(shù)據(jù)： 在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)搜索GSE87182, 這里沒(méi)有直接給出ftp地址葫盼，需要先從BioProject找到SRA號(hào)，可以得到RNA-Seq的SRA的accessi...
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STEP5:差異表達(dá)的mRNA和lncRNA很明顯村斟，得到了表達(dá)矩陣之后贫导，根據(jù)上面的樣本信息，可以按照年齡蟆盹，性別孩灯，取樣部位來(lái)進(jìn)行分組找差異∮饫模可以參考：https://github.com/jmzeng1314/my-R/...
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STEP4: 得到表達(dá)矩陣的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個(gè)步驟而已峰档，中間穿插一些質(zhì)控的手段，每個(gè)步驟選擇好合適的軟件即可寨昙〖パ玻可以參考：一個(gè)植物轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目的實(shí)戰(zhàn) http://www...
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轉(zhuǎn)錄組入門(mén)(6)： reads計(jì)數(shù)前言 實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程舔哪，入門(mén)請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count欢顷，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。需要用腳本合并所有的樣本為表達(dá)矩陣捉蚤。參考...
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轉(zhuǎn)錄組入門(mén)（6）：reads計(jì)數(shù)
作業(yè)要求 1.實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多抬驴，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程，入門(mén)請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count缆巧，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件布持。2.需要用腳本合并所有的樣本為表...
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轉(zhuǎn)錄組入門(mén)(6)： reads計(jì)數(shù)要求 實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程陕悬，入門(mén)請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count题暖，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。需要用腳本合并所有的樣本為表達(dá)矩陣墩莫。參考...
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幾個(gè)秒殺PPT的高（zhe）大(teng)上(ren)的幻燈工具
還在用M$ Powerpoint芙委？太out了，當(dāng)然是個(gè)人都知道ppt有多out狂秦，可別以為Keynote灌侣，或者Prezi就不out了。下面列舉的的工具大多在效果上不弱于這些收費(fèi)...
