測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載并整合清洗高通量腫瘤表達(dá)譜-臨床性狀數(shù)據(jù) -
ＴＣＧＡ和GＴＥｘ的數(shù)據(jù)聯(lián)合分析實(shí)戰(zhàn)0.緣起 很多文章中用到GEPIA這個(gè)網(wǎng)頁(yè)工具來(lái)進(jìn)行TCGA和GTEx表達(dá)量的聯(lián)合比較两残，但在此之前我不知道要怎樣在R語(yǔ)言中實(shí)現(xiàn)钟病。?這個(gè)GEPIA的文章里說(shuō)： The imba...
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TCGA+biomarker——風(fēng)險(xiǎn)因子關(guān)聯(lián)圖
簡(jiǎn)介：風(fēng)險(xiǎn)因子關(guān)聯(lián)圖常見(jiàn)于cox風(fēng)險(xiǎn)比例模型，常見(jiàn)于下圖這種三圖聯(lián)合的展示形式，展示的是由cox風(fēng)險(xiǎn)模型區(qū)分出的高風(fēng)險(xiǎn)和低風(fēng)險(xiǎn)人群在人群比例豺谈、生存時(shí)間（生/死）和關(guān)注的基因表...
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統(tǒng)計(jì)學(xué)（63）-鐵打的方差分析泛啸，流水的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
總綱：很多實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)都是基于方差分析的思想，通過(guò)嚴(yán)格的設(shè)計(jì)属百，找出其中哪個(gè)因素會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成影響蝙茶，或者哪個(gè)因素對(duì)結(jié)果的影響更大。你可能聽(tīng)說(shuō)過(guò)很多方差分析類(lèi)型诸老，如單因素方差分析隆夯、...
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R繪圖：ggplot2繪制火山圖火山圖是測(cè)序分析報(bào)告中最為核心的圖片之一。繪制火山圖的方法有許多别伏，Excel和第三方軟件等蹄衷，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個(gè)R包演示[1][2]。橫坐標(biāo)為Fol...
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蘇菲·瑪索：14歲就傾倒眾生的女神厘肮，52歲又活成了世上最美的女人
女人最性感部位到底是哪里愧口？ 今天聽(tīng)我一個(gè)長(zhǎng)得像林曉峰一樣的舍友說(shuō)了句非常有深度的話： “不要以為長(zhǎng)得好看的人都是繡花枕頭，也許他們的腦袋比你的臉蛋還漂亮类茂，從青春期到現(xiàn)在的大肚...
