在上一篇筆記里乖酬，練習(xí)了使用cellranger aggr整合不同GEM well的樣品（cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr）扑馁，得到的"ou...
IP屬地：寧夏
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cellranger使用的初步探索（4）：R讀取cellranger的輸出文件 -
scRNAseq雙細胞去除-1: DoubletFinder10x平臺的雙細胞率（符合泊松分布1）： 根據(jù)Poisson分布战秋，單個液滴包含超過一個細胞（doublets或multiplets）的頻率隨著上機細胞的濃度而改變妖混。通常如果上...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組建庫原理：SMART绒窑、TargetAmp和10X genomics要實現(xiàn)單細胞mRNA測序僧诚，需要解決2個難題：1. 一個人類細胞中丸逸，RNA總量大約只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大約只有0.2pg儒恋。要把這么少的mR...
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隨機森林的樹是否越多越好善绎？
面試時被問到在隨機森林的樹是否數(shù)量越多越好？開始只考慮構(gòu)建更多的樹一來浪費資源诫尽，二來數(shù)量一定后模型的性能基本保持穩(wěn)定禀酱，隨著樹的增加提升非常小∧良担回來后又想了想剂跟，隨機森林中通過引...
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隨機森林中oob以及oob的作用减途？
在隨機森林bagging法中可以發(fā)現(xiàn)booststrap每次約有1/3的樣本不會出現(xiàn)在bootstrap所采集的樣本集合中，故沒有參加決策樹的建立曹洽，這些數(shù)據(jù)稱為袋外數(shù)據(jù)oob...
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跟著Nature Communication學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語言利用宏基因組的相對豐度數(shù)據(jù)做主坐標(biāo)分析（PcoA)）論文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
