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先來個(gè)簡(jiǎn)單的，之前有小伙伴咨詢一篇Cell文章中的餅圖，展示的是celltype比例，其實(shí)之前我們寫過很多展示細(xì)胞比例的圖，這里復(fù)現(xiàn)這個(gè)3D版的正好彌補(bǔ)我們沒有介紹過3D餅圖...

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最近好幾個(gè)小伙伴都在用我們之前的一個(gè)bulk RNA多組差異分析函數(shù)(重啟之普通R轉(zhuǎn)錄組分析(3)：寫一個(gè)通用的Deseq2多組差異分析函數(shù)[http://mp.weixin...

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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組床佳，因?yàn)槠浼夹g(shù)原因，在很多時(shí)候，會(huì)造成雙細(xì)胞的情況槐雾，一般我們進(jìn)行基礎(chǔ)的質(zhì)控之后，好點(diǎn)的數(shù)據(jù)是沒有問題的幅狮。目前也有很多算法進(jìn)行雙細(xì)胞的預(yù)測(cè)募强，但是一定要注意，無論是哪種...

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有小伙伴發(fā)了一張圖擎值，是關(guān)于富集分析的，只不過展示和我們之前的不太一樣逐抑，是绅基圖+氣泡圖的形式，特點(diǎn)就是GO terms和其對(duì)應(yīng)的關(guān)鍵基因用刹薨保基圖展示进每，GO結(jié)果用氣泡圖展示。這...

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參考鏈接：https://www.bilibili.com/video/BV1ch4y1P7yS/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b...

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這里我們分享一個(gè)熱圖函數(shù)命斧，是一個(gè)可視化的函數(shù)田晚，您只需要提供作圖的matrix數(shù)據(jù)即可。最近對(duì)于圖形注釋使用點(diǎn)比較上頭国葬，所以我們這個(gè)函數(shù)的列注釋使用設(shè)置的·是點(diǎn)的注釋形狀贤徒。我們...

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這里要寫的這個(gè)熱圖主要是為了解決一個(gè)問題跪腹，就是關(guān)于熱圖的注釋。而很多文章中的熱圖也是這種形式嘿歌，可能是有PS钾麸，但是我們還是可以使用函數(shù)代碼實(shí)現(xiàn)，所以這里我們寫一下鲫趁。 參考鏈接：...

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之前一個(gè)圖的做法斯嚎，是一篇《cell reports》上的文章，展示marker基因的表達(dá)的時(shí)候挨厚，添加上了等高線密度圖堡僻，（參考：?jiǎn)渭?xì)胞marker基因可視化的補(bǔ)充---密度圖與...