eggnog-mapper實(shí)現(xiàn)功能注釋 eggNOG-Mapper介紹 通常功能注釋的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常見的方法就是BLAST+BLAST2GO, 或者...
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前一篇推送為大家解讀了2019年發(fā)表的PNAS文章贸街,介紹了如何利用兩組時(shí)間序列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)構(gòu)建特定的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)以及利用這個(gè)網(wǎng)絡(luò)可以得到哪些信息继准。 這一期推送聚焦于具體的分析...
平時(shí)我們做柱狀圖或餅圖都會(huì)用彩色進(jìn)行填充,但是文章有時(shí)候?yàn)榱斯?jié)約成本采用黑白印刷時(shí)候襟交,圖形一般都會(huì)做成各種陰影線條填充模式來進(jìn)行區(qū)分(如下圖)迈倍,R中的ggpattern包剛好...
總結(jié)了一些平時(shí)常用的數(shù)據(jù)處理命令 生信入門 linux實(shí)用基礎(chǔ)1 2 3 Linux實(shí)用基礎(chǔ)1[http://www.reibang.com/p/84f0119f68e5]...
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hello焕梅,大家好迹鹅,今天我們來實(shí)現(xiàn)一下下面的這張熱圖 我們最關(guān)注的就是圖的右邊只標(biāo)記感興趣的基因,如何實(shí)現(xiàn)呢贞言?斜棚?? 準(zhǔn)備作圖文件 接下來,讓我們來實(shí)現(xiàn)一下上面的熱圖弟蚀。 為了繪...
grep grep的基本用法 grep命令是支持正則表達(dá)式的一個(gè)多用途文本搜索工具蚤霞,一般格式為 grep 選項(xiàng) 模式 文件 grep命令的模式十分靈活,可以是字符串义钉,也可以是...
今天我又復(fù)習(xí)了之前看的《Metabolic Pathway Design:A Practical Guide》的第一章昧绣,運(yùn)行了書中python包c(diǎn)obra的代碼,我終于了解微...