發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江西
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腳本更新----細(xì)胞的空間臨近性分析
作者讲衫，Evil Genius 希望我也無奈去搞盜版的時(shí)候，大家能理解~~~性锭，辛苦創(chuàng)作是真的不如搞盜版赠潦。 在空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)中叫胖，細(xì)胞的空間臨近性分析（...
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腳本更新----空間鄰域差異分析（高精度平臺(tái)草冈，Xenium、CosMx瓮增、CODEX怎棱、圖像分割Stereo-seq、HD）作者绷跑，Evil Genius 今天的目標(biāo)拳恋，實(shí)現(xiàn)如下的分析 對(duì)于空間轉(zhuǎn)錄組而言，高精度平臺(tái)圖像分割獲取單細(xì)胞精度的矩陣絕對(duì)是必做的砸捏。大家如果選擇做...
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腳本更新----空間轉(zhuǎn)錄組信號(hào)流COMMOT與空間inferCNV（封裝版）作者谬运，Evil Genius 針對(duì)visium、bin模式的Stereo-seq垦藏、HD等的腳本更新梆暖。 對(duì)于單細(xì)胞而言，大家網(wǎng)上找點(diǎn)代碼分析出個(gè)結(jié)...
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課程補(bǔ)充----單細(xì)胞空間聯(lián)合分析之RCTD封裝版（針對(duì)visium掂骏、bin模式的Stereo-seq轰驳、HD）作者，Evil Genius 關(guān)于RCTD弟灼，本來都不打算更新了级解，R版本的聯(lián)合分析我覺得大家自己寫寫就完了，現(xiàn)在看來田绑，還是需要整理一下勤哗。 文章在R...
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流程更新----空間細(xì)胞聚類及配受體共現(xiàn)分析（針對(duì)visium、bin模式的Stereo-seq掩驱、以及HD）作者俺陋，Evil Genius 今天我們分享一個(gè)簡(jiǎn)答的內(nèi)容，空間細(xì)胞聚類與配受體共現(xiàn)昙篙。 今年的空間課程給了大家一個(gè)方法腊状，當(dāng)然了，都可以用苔可，也都有...
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頂刊方法補(bǔ)充---腫瘤演化與微環(huán)境相互作用作者缴挖，Evil Genius 周末了，我們復(fù)習(xí)一下焚辅，高分文章的方法補(bǔ)充映屋，文章在 (1)WES數(shù)據(jù)分析,如下 1苟鸯、BWA-mem比對(duì)（GRCh38...
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流程升級(jí)---通過生態(tài)位差異分析確定細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變的外在驅(qū)動(dòng)因素作者，Evil Genius 今年不知道大家過的怎么樣棚点？掙到錢了么早处？文章發(fā)表了沒？光陰似箭瘫析，大家珍惜讀書的大好時(shí)光砌梆。 我們今天的分析從空間轉(zhuǎn)錄組...
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流程更新----10XHD的tiff圖片結(jié)合cellpose進(jìn)行細(xì)胞分割分析獲取單細(xì)胞級(jí)別的空間表達(dá)矩陣作者，Evil Genius 不止一次的說過贬循，做HD咸包、Stereo-seq，盡量不要再用bin分割模式杖虾，采用圖像識(shí)別的圖像分割模式烂瘫，獲取單細(xì)胞級(jí)...
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流程升級(jí)---空間鄰域聚類分析與分層分析（高精度平臺(tái)，Stereo-seq奇适、HD坟比、Xenium、CosMx）作者嚷往，Evil Genius 我們今天要實(shí)現(xiàn)的目標(biāo)是葛账，依據(jù)細(xì)胞鄰域的不同進(jìn)行細(xì)胞類型的分層聚類。 我們?cè)诜治龈呔绕脚_(tái)的時(shí)候间影，通過基礎(chǔ)分析注竿，會(huì)拿...