R語言包的安裝 參考文章 在R中大概有幾種包的安裝方式讨衣。 install.packages()常規(guī)包的安裝 括號里面包的名稱要加英文引號，在列出的CRAN鏡像站點(diǎn)列表中選擇一...
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R語言基礎(chǔ)--包的操作與內(nèi)置數(shù)據(jù)集 -
8. 群落結(jié)構(gòu)差異顯著性非參數(shù)置換的多變量方差分析(ANONIS)摇庙、相似性分析(ANOSIM)和多反應(yīng)置換法(MRPP)常被用來評估不同采樣點(diǎn)之間微生物群落組成差異的顯著性锈津。 一般來說，當(dāng)我們通過降...
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R語言基礎(chǔ)之第二部分 操縱數(shù)據(jù)/取子集
R語言基礎(chǔ)之第二部分：操縱數(shù)據(jù)取子集 2.1 構(gòu)建子集[ ]：提取一個or多個類型相同的元素[[ ]]：從列表或數(shù)據(jù)框中提取元素$ ：按名字從列表or數(shù)據(jù)框中提取元素 2.1...
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利用ggpubr+ggplot2做barplot和boxplot圖并顯示顯著性導(dǎo)讀 以前總是借助PS來為新鮮出爐的R圖添加統(tǒng)計(jì)顯著標(biāo)識，但是現(xiàn)在可以不用了，因?yàn)間gbubr可以一站式解決维苔，而且畫的圖堪比SCI級別。話不多說懂昂，擼起袖子搞起來 工作流程 包...
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利用python自NCBI下載fasta和genbank文件
第一部分 自習(xí)室網(wǎng)絡(luò)出奇的差蕉鸳，有時想打開NCBI網(wǎng)頁下載文件時會一直在那里轉(zhuǎn)圈圈，本來很簡單的一件事有時卻要浪費(fèi)好長時間忍法；恰好最近在學(xué)習(xí) Bioinformatics wit...
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相關(guān)性分析及可視化R筆記近日潮尝，因宿舍小趙同學(xué)看文章，看到一張關(guān)于相關(guān)性分析結(jié)果可視化的圖表饿序，并對其表達(dá)含義表示了百思不得其解勉失，于是在我們的男神428宿舍引發(fā)了一波生信小熱潮≡剑可能對于大佬們來說這是很...
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ggplot2高效實(shí)用指南簡介 文章較長乱凿，點(diǎn)擊直達(dá)我的博客，瀏覽效果更好咽弦。本文內(nèi)容基本是來源于STHDA徒蟆，這是一份十分詳細(xì)的ggplot2使用指南，因此我將其翻譯成中文型型，一是有助于我自己學(xué)習(xí)理解段审，另外...
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WGD（全基因組復(fù)制）分析——Ka/Ks及4Dtv值計(jì)算一、4Dtv（四倍簡并位點(diǎn)顛換率）的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
