感謝哥們焚鲜，如果不是你我真的無法運(yùn)行這個(gè)軟件
phylophlan3使用(更新)下載、安裝 軟件運(yùn)行配置文件無需基因組fna或者faa文件基因組是fna爸邢，配置文件（下一步速度慢沟绪，不推薦） 基因組翻譯后的faa（速度更快畸悬，推薦使用）帅掘，配置文件汰蓉。 參數(shù) -o...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河南
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phylophlan3使用(更新)
下載绷蹲、安裝 軟件運(yùn)行配置文件無需基因組fna或者faa文件基因組是fna棒卷，配置文件（下一步速度慢顾孽，不推薦） 基因組翻譯后的faa（速度更快，推薦使用）比规，配置文件若厚。 參數(shù) -o...
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根據(jù)barcode拆分測(cè)序數(shù)據(jù)
擴(kuò)增子測(cè)序不同于其他高通量測(cè)序項(xiàng)目，擴(kuò)增子測(cè)序往往樣品量較大蜒什，但單個(gè)樣品的數(shù)據(jù)量要求不高（因?yàn)閮H僅研究擴(kuò)增區(qū)域的序列）测秸。為了節(jié)約成本，研究者們通常會(huì)把多個(gè)樣品混在一個(gè)文庫灾常，并...
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好奇面試官一般會(huì)就生信分析這一塊問些什么樣的問題霎冯，即將面臨找工作，毫無面試經(jīng)驗(yàn)
Evil_under_Sun 評(píng)論自面試生信工程師2 -
生信、AI雕什、大數(shù)據(jù)缠俺、育種。MiyuanBiotech
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diamond比對(duì)以及結(jié)果數(shù)據(jù)處理
利用diamond比對(duì)數(shù)據(jù) 注意：diamond在無root權(quán)限的linux運(yùn)行比對(duì)命令時(shí)需要加參數(shù)-t /dev/shm創(chuàng)建臨時(shí)文件 注意事項(xiàng):默認(rèn)參數(shù)主要是針對(duì)段短序列，...
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宏基因組分箱（二）Metabat2分箱實(shí)戰(zhàn)
導(dǎo)讀 上一篇：宏基因組分箱（一）Megahit組裝和QUAST質(zhì)量評(píng)價(jià)[http://www.reibang.com/p/41f7d6134c0d]螟蒸。分箱工具有很多落剪，我為什...
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宏基因組分箱（四）Blobology可視化Bin導(dǎo)讀 分箱就是將宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)組裝得到的contigs根據(jù)四核苷酸頻率和豐度模式進(jìn)行打包分類的過程，一個(gè)包裹也就是一個(gè)Bin代表一種微生物尿庐。Metawrap的Blobolo...
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簡(jiǎn)書廣告太多了
一打開簡(jiǎn)書忠怖，廣告就跳出來，次次如此抄瑟。 廣告實(shí)在太多了凡泣，沒完沒了枉疼，總得重新關(guān)了再打開。心想要把簡(jiǎn)書卸載了鞋拟。廣告實(shí)在是太多了骂维，太煩人了贺纲。
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宏基因組 - (3)使用KofamKOALA對(duì)非冗余基因集進(jìn)行KEGG注釋0.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡(jiǎn)單介紹一下方向也可以航闺，說不定以后能互相幫忙～ 1. 這個(gè)工具有在線網(wǎng)頁版，當(dāng)然KEGG注釋還有其他很多工...
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不做無條件咨詢，見諒
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Kraken使用手冊(cè)
Introduction Kraken 是可將分類標(biāo)簽分配給DNA序列的一種序列分類器懈叹，是基于k-mer精確比對(duì)乖杠，并采用最低公共祖先(lowest common ancest...
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宏基因組學(xué)/群體遺傳學(xué) 方向
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宏基因組之基因豐度計(jì)算目前有兩種方式可計(jì)算宏基因組基因的豐度胧洒，一種是基于比對(duì)，比如bwa,bowtie,soapaligner等主流的比對(duì)軟件墨状，另一種是不比對(duì)快速估計(jì)基因豐度卫漫，可以用近倆年來流行的...
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中農(nóng)在讀博士列赎，歡迎關(guān)注個(gè)人公號(hào)【BioparaMeta】一起學(xué)習(xí)、交流
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太牛了老哥通今，這本書我找好久了粥谬，你是國(guó)內(nèi)第一個(gè)翻譯的??
第十章 微生物組數(shù)據(jù)的成分分析
10.1 Introduction to Compositional Analysis（成分分析導(dǎo)論） ①什么是成分?jǐn)?shù)據(jù)？ 根據(jù)韋伯斯特第二版新大學(xué)詞典辫塌，作文是“將部分或元素...
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第十章 微生物組數(shù)據(jù)的成分分析10.1 Introduction to Compositional Analysis（成分分析導(dǎo)論） ①什么是成分?jǐn)?shù)據(jù)漏策？ 根據(jù)韋伯斯特第二版新大學(xué)詞典，作文是“將部分或元素...
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2020-08-17
Mantel test 分析兩個(gè)距離矩陣之間的相關(guān)性 做微生物菌落少不了分析環(huán)境因子（pH臼氨，有機(jī)碳掺喻，總氮，鹽度等）與菌落的相關(guān)性储矩，此時(shí)便需要做CCA和Mantel test ...
