Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA...
IP屬地：江蘇
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【單細(xì)胞入門必讀】單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)和數(shù)據(jù)分析簡(jiǎn)介
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模，時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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對(duì)TCGA數(shù)據(jù)做生存分析怖糊、PCA分析這里做生存分析，已經(jīng)不需要正常樣本的表達(dá)矩陣了髓绽，所以需要過(guò)濾纵散。而且臨床信息棘脐，有需要進(jìn)行整理捕儒。 可以很明顯看到冰啃，腫瘤病人的生存受著診斷癌癥的年齡的影響，卻與性別無(wú)關(guān)刘莹。在相對(duì)年長(zhǎng)...
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機(jī)器學(xué)習(xí)算法入門：從貝葉斯到深度學(xué)習(xí)及各自優(yōu)缺點(diǎn)
文章發(fā)布于公號(hào)【數(shù)智物語(yǔ)】（ID：decision_engine）亿笤，關(guān)注公號(hào)不錯(cuò)過(guò)每一篇干貨。 來(lái)源：機(jī)器之心（ID：almosthuman2014）編譯 原文：static...
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哪里可以獲得.hdrs文件栋猖？
extract-as 簡(jiǎn)介 該腳本需要兩個(gè)參數(shù)： 轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)的 gtf 文件 基因組長(zhǎng)度統(tǒng)計(jì)文件，后綴為 .hdrs汪榔，內(nèi)容如下：>chr1 /len=249250621 /n...
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【R>>clusterProfiler】富集分析神器Y叔的clusterProfiler迎來(lái)了4.0版本蒲拉，并發(fā)表在了《The Innovation》雜志上肃拜。 1.GO分析 2.KEGG分析 3.Biomedical Gene ...
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mRNA-seq學(xué)習(xí)（四）：使用RSEM進(jìn)行差異表達(dá)分析
1. prepare-reference 如果用RSEM對(duì)比對(duì)后的bam進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量，則在比對(duì)過(guò)程中要確保比對(duì)用到的索引是由rsem-prepare-reference產(chǎn)生...
