水稻的基因號(hào)大致分為兩類(lèi)买鸽，一類(lèi)是RAP號(hào)，格式為“Os-Chr-g-number”飒泻，另一類(lèi)是MSU號(hào)，格式為“LOC_Os-Chr-g-number”吏廉。平時(shí)做各種分析時(shí)泞遗，需要...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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[基因組學(xué)]使用biomaRt做水稻ID轉(zhuǎn)換及相關(guān)信息的填充
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iTOL | 進(jìn)化樹(shù)在線制作美化工具一、基本操作 1. 使用界面 可以注冊(cè)后使用席覆，點(diǎn)擊upload即可上傳樹(shù)文件 2. 基本操作 右側(cè)controls負(fù)責(zé)對(duì)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行修改： basic：主要負(fù)責(zé)修改樹(shù)的造型史辙、分...
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設(shè)計(jì)dCAPS標(biāo)記及其酶切產(chǎn)物產(chǎn)物電泳區(qū)分的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)dCAPS標(biāo)記及dCAPS標(biāo)記酶切產(chǎn)物電泳實(shí)驗(yàn) dCAPS標(biāo)記的使用原理，如圖A（參考NCBI）所示： 可以簡(jiǎn)單的理解為：在wild的片段中含有酶切位點(diǎn)佩伤，能被特異的切開(kāi)聊倔，...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)?lái)的是16年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level expression analy...
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【不定期更新】Bedtools大全--42個(gè)子命令介紹參考鏈接： 用法大全: 官方說(shuō)明：https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
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bedtools批量提取基因組指定位置序列
bedtools批量提取基因組指定位置序列 之前已經(jīng)介紹過(guò)很多提取序列的方法，有腳本的也有軟件的生巡，這里再介紹一種方法耙蔑。 用到軟件是bedtools，具體方法如下： Optio...
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2019意猶未盡的基因組可視化IGV（一）劉小澤寫(xiě)于19.6.8之前最開(kāi)始學(xué)習(xí)IGV的時(shí)候?qū)戇^(guò)兩篇推文孤荣，當(dāng)時(shí)簡(jiǎn)單做了了解甸陌，但有朋友說(shuō)意猶未盡须揣，嗯我也這么覺(jué)得，總覺(jué)得還是學(xué)的不夠邀层。推薦閱讀：https://github...
