下載NCBI數(shù)據(jù)驼鞭，使用ascp命令是最快的，但是小編之前嘗試用該命令下載SRA數(shù)據(jù)讹堤，查閱了百度上的各種參數(shù)汽畴，最后還是沒有成功旧巾，可能是有個“墻”存在的原因，小編后來有一段時間使...
發(fā)簡信
IP屬地：青海
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NCBI原始SRA數(shù)據(jù)下載
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CNCB原始數(shù)據(jù)下載CNCB（China National Center for Bioinformation忍些，國家生物信息中心）鲁猩，對標(biāo)的NCBI，對國內(nèi)研究者來說罢坝，數(shù)據(jù)上傳跟下載方便的多廓握，現(xiàn)在...
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集群SGE作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)
0. 一些基本概念 計算機(jī)集群：高性能集群(High Performance Computing，簡稱HPC)是一組松散或緊密連接在一起工作的計算機(jī)嘁酿。由于這些計算機(jī)協(xié)同工作隙券，...
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商務(wù)與經(jīng)濟(jì)統(tǒng)計技術(shù)（九）：估計與置信區(qū)間
1.點估計與置信區(qū)間 1.1名詞解釋 點估計：從樣本計算得到的用以估計總體參數(shù)的統(tǒng)計量。置信區(qū)間：由樣本數(shù)據(jù)構(gòu)造的一個范圍闹司，從而總體參數(shù)在改范圍內(nèi)以給定的概率出現(xiàn)娱仔。給定的概率...
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生信常用數(shù)據(jù)庫（四）：NR數(shù)據(jù)庫分類搭建前言 因為完整的NR數(shù)據(jù)庫下載下來后數(shù)據(jù)量非常龐大，在我們做序列比對的時候游桩，尤其是很多很大的序列比對的時候牲迫，特別消耗計算資源和內(nèi)存，最重要的是很耽誤分析的周期借卧，因此將NR...
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基因組注釋--重復(fù)序列注釋（二）：RepeatMasker安裝與使用
前言 RepeatMasker是一個通過已有數(shù)據(jù)庫預(yù)測重復(fù)序列的軟件盹憎，依賴于RepBase數(shù)據(jù)庫和第三方比對軟件（RMBlast、Crossmatch铐刘、HMMER陪每、ABBla...
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基因組注釋--重復(fù)序列注釋（三）：RepeatModeler安裝與使用
目錄 RepeatModeler 是從頭預(yù)測transposable element (TE)的軟件，它的核心是結(jié)合了三大預(yù)測軟件（RECON, RepeatScout an...
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赤裸裸的統(tǒng)計學(xué)（九）：中心極限值定律
整體有標(biāo)準(zhǔn)差，平均數(shù)檩禾。 抽樣也有標(biāo)準(zhǔn)差挂签，平均數(shù)。 抽樣的平均數(shù)分布在整體平均數(shù)的左右盼产，呈正態(tài)分布竹握，這個正態(tài)的?是標(biāo)準(zhǔn)誤。標(biāo)準(zhǔn)誤的計算公式為S/√n辆飘，S為群體...
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基因組注釋--重復(fù)序列注釋（一）：Trf軟件安裝與使用
前言 動植物基因組注釋包括重復(fù)序列注釋以及基因結(jié)構(gòu)注釋，重復(fù)序列注釋是注釋中非常重要的環(huán)節(jié)谓传，主要包括的軟件有Trf蜈项、LTR_Finder、Piler续挟、RepeatScou...
