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  • @passby_W 我之前也有這個(gè)問(wèn)題礼华,應(yīng)該是注釋文件的問(wèn)題

    hisat2+stringtie+deseq2分析RNA-SEQ數(shù)據(jù)

    hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisat2 -p 2 --dta -x ~/RNASEQ/inde...

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    DESeq2差異基因分析和批次效應(yīng)移除

    差異基因鑒定 基因表達(dá)標(biāo)準(zhǔn)化 不同樣品的測(cè)序量會(huì)有差異圣絮,最簡(jiǎn)單的標(biāo)準(zhǔn)化方式是計(jì)算counts per million (CPM),即原始reads count除以總reads...

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    RNA-seq(9):功能富集分析

    這部分開(kāi)始進(jìn)行基本的富集分析捧请,兩類(lèi) A:差異基因富集分析(不需要表達(dá)值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有無(wú)差異棒搜,需要全部genes...

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    PCA作圖里面的箭頭是干嘛用的疹蛉?

    作圖的目的是希望在圖里面發(fā)現(xiàn)問(wèn)題或者解釋問(wèn)題,當(dāng)然更本質(zhì)一點(diǎn)就是你想解決什么問(wèn)題力麸? 前幾天做了一個(gè)PCA的圖可款,圖是畫(huà)出來(lái)了,但是問(wèn)題有很多克蚂,比如說(shuō)主成分是是啥意思闺鲸,圖里面的箭...

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