前端開(kāi)發(fā)語(yǔ)言和技術(shù)存炮，數(shù)據(jù)分析撼玄，數(shù)據(jù)可視化夺姑。資源池：https://t.zsxq.com/zFUF2zv
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal！ 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)掌猛，但是無(wú)論是自身實(shí)驗(yàn)需要盏浙，還是從NCBI的GEO...
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RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做？[https://www.jians...
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收錄比較基因組學(xué)，進(jìn)化基因組學(xué)慕蔚，群體基因組學(xué)丐黄，分子進(jìn)化，及相關(guān)領(lǐng)域的各類文章坊萝。特別地孵稽。由于是簡(jiǎn)書，建樹(shù)的內(nèi)容當(dāng)然是必不可少了十偶。 歡迎大家投稿
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使用modeltest-ng和raxml-ng構(gòu)建ML系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
雖然簡(jiǎn)單菩鲜，但絕對(duì)首發(fā)……該給自己的系統(tǒng)發(fā)育構(gòu)建流程升級(jí)了，新版本軟件不僅速度快惦积，而且對(duì)用戶友好接校！ modeltest-ng 的速度是真的飛快！modeltest-ng 和 r...
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IQ-TREE最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的神器IQ-TREE：最大似然法構(gòu)建精確、快速蛛勉、靈活鹿寻、廣泛的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) IQ-TREE自2011年就已經(jīng)開(kāi)發(fā)并開(kāi)源，至今都有專業(yè)團(tuán)隊(duì)維護(hù)诽凌，其名字來(lái)源于IQPNNI和TREE-PUZ...
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如何對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后毡熏，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個(gè)問(wèn)題侣诵，需要對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋痢法。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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大愛(ài)洲更
「學(xué)轉(zhuǎn)錄組入門生信」第一周從環(huán)境配置開(kāi)始
我們第一周目標(biāo)有三個(gè): 熟悉Linux環(huán)境登錄服務(wù)器Linux基本命令PATH的意義 學(xué)習(xí)conda管理環(huán)境如何在conda中添加channel如何用conda安裝和卸載軟件...
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學(xué)習(xí)生物信息，我都應(yīng)該掌握那些內(nèi)容躬络？持續(xù)更新ing.....最后更新時(shí)間：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限： eg： 7=4+2+1 #代表w+r+x權(quán)限...
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Smart is the new Sexy
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CentOS 7 中firewall-cmd命令
如果你的系統(tǒng)上沒(méi)有安裝使用命令安裝安裝firewalld 防火墻yum install firewalld 開(kāi)啟服務(wù)systemctl start firewalld.ser...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過(guò)conda安裝穷当，省去了很多的安裝提茁、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件膘滨，conda一行命令就搞定了甘凭。前兩天有個(gè)胖友問(wèn)我gatk 3.8的版本在哪里...
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2019-04-16簡(jiǎn)單的利用R語(yǔ)言繪制進(jìn)化樹(shù)（模仿筆記） 必備軟件：treeio丹弱，ggtree。需要首先安裝Bioconductor铲咨，官方網(wǎng)址:http://www.bioconductor....
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2019-04-15PCA繪圖模仿筆記 PCA（Principal Component Analysis）是一種常用的數(shù)據(jù)分析方法躲胳。PCA通過(guò)線性變換將原始數(shù)據(jù)變換為一組各維度線性無(wú)關(guān)的...
