今天還是在做張阿姨的項(xiàng)目徽级，還是那100多個(gè)菌裕便，她說要blast一下抗性基因，那就比咯催训，最出名與權(quán)威的的細(xì)菌抗性基因庫(kù)自然肯定是resfinder了洽议。 寫個(gè)循環(huán)，刷刷弄完真開心...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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超簡(jiǎn)單python腳本實(shí)現(xiàn)從resfinder+blast下機(jī)數(shù)據(jù)到csv抗性基因矩陣 -
2022-05-24如何設(shè)計(jì)QPCR引物本教程是利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行設(shè)計(jì)漫拭。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/]第一步：準(zhǔn)備所要設(shè)...
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[ZT] 常用在線序列比對(duì)工具文章來源：企鵝號(hào) - 卡嘿喲 從早期序列比對(duì)工具Needleman-Wunsch绞铃、Smith-Waterman到后來的Clustal算法，以及近幾年的Muscle嫂侍、MAFFT...
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@shenghuanjing 好滴好滴 十分感謝??
使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP儿捧、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing Checking version: snpEff -version is >= 4.3 - ok, have 5.0 您好 我的版本是5.0誒 好像也不太可以??
使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP荚坞、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing 這樣的
ERROR: Could not find .aligned.fa/.vcf in 120121使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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ERROR: Could not find .aligned.fa/.vcf in 120121
使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP菲盾、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing VScode上的服務(wù)器 CentOS
使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP颓影、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@e7e5693cfe90 您好，我也遇到了一樣的報(bào)錯(cuò)懒鉴，請(qǐng)問解決了嘛??
我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程
個(gè)人進(jìn)行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]诡挂，主要是可以一次批量完成。準(zhǔn)備工作：1.待分析的序列文件（fa...
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男，某西北高校博士在讀悉默，摸魚專業(yè)戶城豁。
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您好 請(qǐng)教一下,生成.sh文件后沒辦法運(yùn)行sh文件，沒有輸出core.cln 是為什么呀??
使用Snippy構(gòu)建細(xì)菌基因組SNP抄课、core SNP和系統(tǒng)進(jìn)化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亞墨爾本大學(xué)的 Torsten Seemann[https://twitter....
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您好 運(yùn)行.sh腳本時(shí)一直報(bào)錯(cuò)為什么 命令行 sh snippy.sh
八. SNP檢測(cè)和進(jìn)化分析（Snippy）
一. 簡(jiǎn)介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP檢測(cè)的軟件唱星，可以通過分析得到核心SNP，進(jìn)行比對(duì)構(gòu)建進(jìn)化樹跟磨。 ...
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你好间聊，想請(qǐng)教一下 multi報(bào)錯(cuò)，unreadable file是什么原因呀
我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程
個(gè)人進(jìn)行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]抵拘，主要是可以一次批量完成哎榴。準(zhǔn)備工作：1.待分析的序列文件（fa...
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檢測(cè)snp和InDel的工具：snippy~可用于檢測(cè)兩條fasta序列之間的變異生成vcf格式文件這個(gè)軟件的github主頁(yè) https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 我是...
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不做無條件咨詢墩瞳，見諒
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在寫了（行數(shù)1喉酌，字?jǐn)?shù)0）。
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2019.8月中旬開始系統(tǒng)自學(xué)生信鲜锚，<br>自學(xué)路漫漫索性報(bào)個(gè)班突诬。<br><br>生信技能樹真的很棒苫拍！<br><br>這是我的一個(gè)學(xué)習(xí)筆記平臺(tái)，點(diǎn)滴記錄旺隙。
