前言 本次主要使用Seurat比較STAR與Cellranger的輸出結(jié)果砚殿，只會(huì)進(jìn)行簡(jiǎn)單的聚類工作。 數(shù)據(jù)讀入 數(shù)據(jù)比較 根據(jù)箱線圖价淌，直方圖和矩...

劉小澤寫(xiě)于19.10.24筆記目的：根據(jù)生信技能樹(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索Smartseq2技術(shù)及發(fā)育相關(guān)的分析課程鏈接在：http://jm.g...

劉小澤寫(xiě)于19.5.16分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)，尤其是10X需要對(duì)barcode填具、UMI憨愉、拆分等名詞進(jìn)行了解，于是追根溯源臂港，發(fā)現(xiàn)理解它的工作原理對(duì)后續(xù)分...

劉小澤寫(xiě)于19.4.3-4果然是大文章森枪，內(nèi)容比較豐富。熱烈慶祝sci-hub合法化审孽，這下大家可以自由自在使用了 之前的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究中县袱，許多實(shí)...

劉小澤寫(xiě)于19.4.1中午寫(xiě)到晚上，總共10個(gè)小時(shí)研究一篇綜述佑力，收獲滿滿式散，還是看綜述最給力，帶領(lǐng)我們快速了解一個(gè)領(lǐng)域 這篇關(guān)于單細(xì)胞的綜述發(fā)表于...

劉小澤寫(xiě)于19.4.4+4.7結(jié)合一篇文章+scater說(shuō)明書(shū)打颤，并做了一些個(gè)人修改 首先上文章和scater包說(shuō)明書(shū) 來(lái)自https://f10...

劉小澤寫(xiě)于19.4.5許多單細(xì)胞分析包中都會(huì)遇到這個(gè)對(duì)象暴拄，那么說(shuō)明書(shū)當(dāng)然是最好的學(xué)習(xí)工具了 說(shuō)明書(shū)地址：https://bioc.ism.ac....

劉小澤寫(xiě)于19.3.26這次主要內(nèi)容是更新一下第四期的QC部分，另外簡(jiǎn)單看一下標(biāo)準(zhǔn)化（沒(méi)有涉及流程）编饺，因此標(biāo)題定了一個(gè) 四plus 慢慢翻開(kāi)細(xì)枝...

劉小澤寫(xiě)于19.3.26陌生的領(lǐng)域就像一張白紙乖篷，怎么畫(huà)就看自己了 前言 關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序，我們已經(jīng)知道了它和bulk RNA-seq的區(qū)別透且，簡(jiǎn)單說(shuō)...

劉小澤寫(xiě)于19.3.16看了一篇綜述撕蔼，又加了一些擴(kuò)展知識(shí) 文章 這是一篇2017發(fā)表在Genome Medicine上的文章A practica...